CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点：
试验设计：尽量进行试验组别设计和进行生物学重复检测，提高后续验证的阳性率。常规过表达单组（AbIPvsIgGIP）；动态互作组学（实验组vs对照组vsIg组）。根据目的设计适当的生物学重复。如果后续以CoIP-Mass数据进行互作组标准分析，则需要3-4组生物学重复；如果后续以寻找关键互作蛋白，进行机制深入研究，则建议1-2次生物学重复。经验显示单次重复假阳性率90%。
蛋白表达和细胞量：细胞用量要求大(2-10e7细胞量），建议不少于5e7（金标准：320g离心细胞量50μl，保障项目用量）。低表达蛋白，建议使用过表达组进行检测。蛋白表达可根据WB结果或初步根据数据库判定（ProteomicsDB；HumanProteinAtlas）。 Co-IP和ChIP基本原理方面的区别有什么。湖南互作机制CoIP mass
Co-IP（免疫共沉淀）实验的内源检测是验证蛋白质相互作用的关键步骤。内源检测的目的是确认在细胞内自然状态下，目标蛋白与预测相互作用的蛋白是否真实存在相互作用。内源检测的成功与否直接关系到Co-IP实验结果的可靠性。如果内源检测结果阳性，说明目标蛋白与预测相互作用的蛋白在细胞内真实存在相互作用，这为后续的蛋白质功能研究和药物开发提供了重要的线索和依据。需要注意的是，内源检测可能受到多种因素的影响，如抗体特异性、细胞裂解条件、洗涤条件等。因此，在进行Co-IP实验时，需要严格控制实验条件，选择特异性强的抗体，并进行充分的洗涤步骤，以确保内源检测结果的准确性和可靠性。四川免疫沉淀CoIP WB检测IP-WB实验操作步骤有哪些。
免疫共沉淀也存在一些局限性。例如，它可能无法检测到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用。此外，两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用。此外，实验前需要预测目的蛋白以选择相应的抗体，因此，如果预测不正确，实验可能无法得到结果，这使得这种方法具有一定的冒险性。总的来说，免疫共沉淀是一种强大的技术，它能够为我们提供关于蛋白质相互作用的宝贵信息。然而，为了得到准确和可靠的结果，我们需要谨慎地解释和分析实验数据，并考虑到这种方法的局限性。
CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点：
互作蛋白筛选和验证：数据分析以非标定量信号强度（LFQintensity和FC>10）作为强阳筛选，以文献查阅，功能匹配，批量CoIP-WB验证，提高验证成功率。理想CoIP-MS结果的蛋白定量都到超过1000种蛋白。其中绝大部分蛋白为非特异结合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信号强度和差异倍数作为参考（相对强信号和差异），分析实验组中明显定量较高且差异较大的蛋白，作为重要候选蛋白。同时对重要候选蛋白进行STRING互作分析，文献分析，目的蛋白功能匹配分析，选择Top的4-5个蛋白进行CoIP-WB验证，提高CoIP-WB成功率。 Co-IP（免疫共沉淀）技术应用场景。
免疫共沉淀实验步骤主要包括以下五个部分：样品处理：将细胞或组织样品进行裂解，得到待检测的蛋白质混合物，并加入蛋白酶抑制剂以避免目标蛋白被降解。抗体处理：将专一的抗体连接到亲和树脂上，如蛋白A的亲和树脂或蛋白G的亲和树脂，或将蛋白与其特异性抗体结合，新形成的复合物与封闭剂缓慢摇摆在二氧化硅珠上，使碘酸钙交联后节制反应。免疫共沉淀：将有抗体树脂的样品与吸附抗体树脂形成免疫复合物。洗涤：采用洗涤缓冲液对样品进行洗涤，以去除非特异性的蛋白质和杂质，同时尽量避免对复合物的影响。洗涤缓冲液选择对样品不会引起较大影响的缓冲液和洗涤剂。蛋白鉴定：将沉淀的复合物通过SDS-PAGE分离出来，并进行Western blotting检测目标蛋白及其配偶蛋白。另一方面，也可以直接使用质谱分析检测。Co-IP（免疫共沉淀）技术广泛应用于生物学和医学研究领域。广东免疫共沉淀CoIP联合质谱
CoIP是研究蛋白质与蛋白互作的实验技术。湖南互作机制CoIP mass
CoIP实验细胞的收集及裂解方法：
收集2E7个细胞样品，加入PBS洗涤细胞，离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀，冰上孵育30min，期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min，取上清，进行蛋白浓度测定及后续实验。
CoIP实验免疫复合物的制备：
在离心管中，将每个样品的细胞裂解液与2-10μg免疫沉淀抗体结合。每个免疫沉淀反应推荐的总蛋白量为500-1000μg，由PierceBCAProteinAssay蛋白浓度检测试剂盒测定。
用免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液将抗体/裂解液稀释至500μL。
在室温下孵育1-2h，或4℃过夜，以形成免疫复合物。 湖南互作机制CoIP mass
