重庆N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基， 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。GalNAcEXO 酶来源于Akkermansia muciniphila，在大肠杆菌中表达，带有His标签，分子量为52 kDa。重庆N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

用于离心柱中糖蛋白去胶基化的固定化酶。Genovis的FucosEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的FucosEXO酶，用于糖蛋白的去氟糖基化，而不会用酶污染z终制剂。Microspin 色谱柱可用于 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去胶基化。1. 易于使用的离心柱；2. 提高酶与底物的比例，提高消化效率；3. z终样品中不含酶。有效去除α1-2,3,4连接岩藻糖：分析用复杂聚糖结构修饰的糖蛋白可能具有挑战性，需要高效和特异性的酶学工具。Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物，用于有效水解 N-和 O-糖蛋白或寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖残基，无需辅助因子或添加上海固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发OglyZOR 是一种内切糖苷酶用于确认O-糖的存在和降低样品的异质性。

Genovis的FucosEXO 是 α-岩藻糖苷酶的混合物，用于有效水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接岩藻糖残基。它是 N-和 O-糖蛋白的聚糖结构分析以及寡糖的外切糖苷酶阵列的宝贵工具。1. 高效α-岩藻糖苷酶混合物 – 快速去除 α1-2、α1-3 和 α1-4-连接的岩藻糖；2. 可靠的酶解增加了对外切糖苷酶阵列的信心；3. 可固定在即用型离心柱中。用于糖蛋白去氟糖基化的冻干酶。Genovis的FucosEXO冻干剂以冻干粉的形式提供，装在2000单位的小瓶中，用于2mg糖蛋白的去碳基化。

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用：O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率（图3）。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽，而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR （1） 具有更具选择性的氨基酸序列偏好，此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外，ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解，如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品（T184-S199和T200-H204;图2b和d），而在ImpaRATOR消化的样品中，具有漏裂的相应肽（S184-H204）的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率，但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构，包括唾液酸化物种。例如，条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较，在OpeRATOR中，必须去除唾液酸才能产生酶活性，这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之，ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。依那西普是一种 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的铰链区域。

GalactEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila，并在大肠杆菌中表达。GalactEXO由两种半乳糖苷酶组成，均带有His标签，组分的分子量为87 kDa和109 kDa。用于水解糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的冻干酶。Genovis的GalactEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 2000 单位小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解 β1-3,4-连接的半乳糖。1. 用于方法开发的灵活格式；2. 可以结合酶以提高效率； 3. 适用于自动化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可！将混合物加载到GlycOCATCH上，洗涤树脂，并用8M尿素洗脱结合的肽。纯化后，在RP-LC-MS上分离样品。数据显示，糖苷酸肽的选择性纯化，携带he心1-O-聚糖。IgA 特异性 O-糖肽富集：IgA 抗体包含 N-连接的糖基化和重度 O-糖基化的铰链区域。胰蛋白酶消化IgA后，将肽和genovis 的SialEXO的混合物加载到GlycOCATCH树脂上，并用PBS和离心洗涤。用 8 M 尿素洗脱显示预期的 O-糖基化铰链肽富集，具有不同程度的糖基化。评价抗体片段对完整蛋白聚集的影响：可使用Genovis的IgdE酶（FabALACTICA®）和PNGaseF酶。黑龙江用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶

用于糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的水解，而不会用酶污染z终制剂。重庆N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖：Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性，这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中，例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟，并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解，这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。重庆N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究