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PNGaseF去糖基化酶基本参数
  • 品牌
  • Genovis
  • 型号
  • L1-F02-025
PNGaseF去糖基化酶企业商机

使用Genovis的OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析:依那西普是一种 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的铰链区域。将依那西普与OpeRAT一起孵育,并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促红xibao生成素 (EPO) 是一种具有单个 O-糖基化位点的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO进行去唾液酸化后,用OpeRAT消化天然蛋白,并通过反相LC-MS分析所得蛋白质片段。O-糖基化的位点可以通过识别OeRATOR消化位点直接推断出来。为了获得良好性能,需要去除唾液酸助剂,因此购买中包括2000个单位(如果SialEXO冻干)。1. 用于方法开发的灵活产品形式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的,而该酶在N-聚糖上没有活性。OpeRATOR和SialEXO处理后,O-糖基化蛋白被消化成携带O-聚糖的肽。消化发生在O-糖基化位点的N端。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置,因为它们在蛋白质折叠发生后附着。江西高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

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为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性,将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时,OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc)。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品,以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化:O-糖基化生物制药(如依那西普)很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数,我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解,而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。福建N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究GalactEXO中的酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。

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GlycOCATCH®亲和纯化:用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽亲和纯化的富集树脂。GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供。该产品包含:4 个 GlycOCATCH 亲和纯化微离心柱,每个柱能够结合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白(总共 200 μg)。Genovis的SialEXO 冻干 200 单位,用于去除唾液酸;OpeRATOR 冻干 200 单位,用于结合的 O-糖蛋白的可选洗脱方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集;2. 复杂样品的特异性净化;3. 用于改进 MS 分析的样品制备。O-糖基化蛋白和肽的特异性富集:O-连接聚糖参与多种生物过程,包括抑制病原体引起的gan染、炎症反应、造血和细胞信号传导。

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率(图3)。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽,而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具选择性的氨基酸序列偏好,此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外,ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解,如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品(T184-S199和T200-H204;图2b和d),而在ImpaRATOR消化的样品中,具有漏裂的相应肽(S184-H204)的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率,但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构,包括唾液酸化物种。例如,条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较,在OpeRATOR中,必须去除唾液酸才能产生酶活性,这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的铰链区域。

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Fc N-聚糖在抗体的效应功能中起着至关重要的作用,但可能会增加蛋白质表征测定的复杂性。在天然条件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游离N-糖以及去糖基化抗体的功能和结构。 为了证明PNGase F固定化和PNGase F冻干在天然反应条件下有效去除Fc N-聚糖,对zhiliao性抗体曲妥珠单抗进行了处理。图2中的质量数偏移表明,在37°C下用Genovis的PNGase F冻干或PNGase F固定化孵育1小时后,曲妥珠单抗上的Fc N-聚糖成功去除,与在溶液中用PNGase F冻干处理的样品相比,没有酶干扰用PNGase F固定处理的样品的分析。OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶,可消化携带he心 1 O-聚糖的蛋白质,糖基化(he心 1)Ser 和 Thr 残基的 N 端。吉林冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。江西高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

用于水解离心柱中糖蛋白上的N-聚糖的固定化酶。 Genovis的PNGase F 固定化微离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的 PNGase F 酶,用于在样品中酶峰减少的糖蛋白上水解 N-糖。 将糖蛋白样品与PNGase F一起在离心柱中固定,然后通过离心步骤轻松收集去糖基化的蛋白质。由于空间位阻,PNGase F对某些糖蛋白的活性可能缓慢或受到抑制 - 在这些情况下可能需要更长的孵育时间或糖蛋白变性。 Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.2 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3.z终样品中的酶峰减少。江西高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis

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