北京用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

Genovis的SialEXO产品是用于去除和分析唾液酸的唾液酸酶。这些酶对天然糖蛋白或游离的聚糖结构上存在的 N- 和 O-连接聚糖均具有活性。SialEXO用于在用OpeRATOR或OglyZOR消化之前预处理O-糖基化蛋白。其他应用包括降低样品复杂性、电荷异构体分析和外切糖苷酶阵列。N-连接、O-连接和游离聚糖的高效去唾液酸化快速去除唾液酸，增强对蛋白质电荷变体的分析可固定在即用型离心柱中。然后可以用FabRICATOR消化所得的去糖基化蛋白，并通过中级质谱分析。我们将该工作流程应用于依那西普的分析，虽然未经处理的TNFR结构域过于复杂而无法分析，但O-聚糖组成可以在用PNGase F处理后进行分离和比较。OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。北京用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

α连接的Genovis的GalNAcs的水解：GalNAcEXO 是一种 α-N-乙酰半乳糖胺苷酶，可有效水解糖蛋白上的末端 GalNAc 残基。与丝氨酸或苏氨酸连接的 GalNAc（称为 Tn 抗原）被 GalNAcEXO 快速有效地水解，并且该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAcs 上显示出活性。Genovis的GalNAcEXO 是一种外α-N-乙酰半乳糖胺酶，用于有效水解与糖蛋白（Tn 抗原）中的丝氨酸或苏氨酸残基相连的 α-N-乙酰半乳糖胺 （GalNAc）。该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAc 上显示活性。GalNAcEXO 在天然条件下水解糖蛋白上的 GalNAc，在 pH 值 6.0 至 7.6 范围内具有高度活性。北京用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发C1抑制剂的去糖基化：使用PNGaseF、OglyZOR和SialEXO、GalNAcEXO1。

Genovis的PNGase F（肽 N-糖苷酶 F）是一种糖酰胺酶，可水解多肽天冬酰胺与所有哺乳动物天冬酰胺连接复合物、杂交或高甘露糖寡糖的内层 GlcNAc 之间的酰胺键。该酶用于MS分析前的样品制备，以降低蛋白质异质性并实现游离的聚糖分析，并研究N-聚糖的功能作用。1. 对所有哺乳动物N-聚糖的高效水解；2.对多种糖蛋白具有活性；3.可固定在即用型离心柱产品形式；4. 自动化友好型，96孔板，用于高通量 N-糖去除。Genovis的ImpaRATOR 是一种 O-糖依赖性蛋白酶，可消化携带粘蛋白型。O-聚糖的蛋白质，包括唾液酸化物质、糖基化丝氨酸和 Thr 残基的 N-末端。该酶产生携带 O-糖的糖肽，从而实现 O-糖谱分析、位点占用测定和 O-糖肽图谱以及使用 LC-MS 分析的中级方法。1. 特异性广 - 接受多种 O-聚糖变体，包括唾液酸化物种；2. 可靠O-聚糖特异性蛋白酶 – 消化丝氨酸/苏氨酸糖基化位点的 N 末端；3. 稳健的消化，增强复杂生物制药的表征。

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用：O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率（图3）。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽，而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR （1） 具有更具选择性的氨基酸序列偏好，此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外，ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解，如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品（T184-S199和T200-H204;图2b和d），而在ImpaRATOR消化的样品中，具有漏裂的相应肽（S184-H204）的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率，但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构，包括唾液酸化物种。例如，条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较，在OpeRATOR中，必须去除唾液酸才能产生酶活性，这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之，ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。采用合适的酶策略来去除这些GalNAc并简化生物制药的表征。

Genovis的SialEXO固定化用于复杂糖蛋白的去唾液酸化：在设置反应条件时，需要在所需的反应时间和完成反应所需的酶量之间进行权衡。较高的酶量可保证在更短的时间内完成周转，但会使下游分析复杂化。为了避免此类问题，我们以离心柱形式固定了活性SialEXO。这允许以更短的孵育时间孵育具有明显更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis测试了 SialEXO 冻干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制剂上的性能。这种糖蛋白是一种具有挑战性的底物，具有 6 个 N- 和多达 26 个 O-聚糖，由 α2,3 和 α2,6 连接的唾液酸修饰。对游离的N-聚糖的分析表明，SialEXO在溶液中完全脱唾液酸化，SialEXO固定化。融合蛋白和其他糖基化蛋白上的 N 和简单的粘蛋白型 O-聚糖。北京用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

并且该酶还在 α1-3 连接的末端 GalNAcs 上显示出活性。北京用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发

Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基， 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。北京用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发