环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20篇以上,“云序制造”越来越多的出现在科研论文当中。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的公司,拥有先进的技术,专业的团队,精密的仪器。环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域新的研究热点。湖北RIP环状平台
鸡白血病病毒亚群(ALV-J)是一类逆转录病毒,该病毒会引起一种重要的感ran性疾病。患病的家禽会导致产蛋率的下降,大面积影响到家禽养殖产业。感ranALV-J的鸡免疫系统会受到严重的抑制并引起多种tumour疾病从而产生很高的死亡率,目前还不能通过接种疫苗的方式来防御这种疾病。来自华南农业大学广东省重点实验室的研究团队通过环状RNA测序的方式研究了病毒抗性与病毒易感的鸡肝脏组织当中环状RNA的表达,发现了32个差异表达的环状分子,其中12个在ALV-J抗性样本中表达量明显升高,而20个在易感样本中表达量更高,而生信预测表明这些环状RNA分子能够调控免疫分子通路的信息传递从而改变生物体的抵抗力。西藏云序生物环状目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。
环状RNA是什么?环状RNA(circRNAs)是一类不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。目前发现的circRNAs主要来源于基因外显子exon,但还有其他类型,比如来源于内含子intron,基因间intergenic,反义链antisense,重叠区senseoverlapping。首先需要确定好研究物种,疾病模型,样品类型等基本信息。接下来,通过高通量手段即RNA-seq(云序提供全转录组-seq或circRNA-seq)或文献报道,筛选差异表达的circRNA。如果想短平快的发表3-5分的文章,那么表达谱分析显得再合适不过了。如果有大量的临床样本,那么做分子标志物也是很easy的,思路和表达谱分析相似如下图展示,不过多了临床样本的统计和验证。(比如KM曲线,ROC曲线,PAM分析等等)
研究思路:作者首先分离了小鼠脑组织,提取脑周质外泌体,通过外泌体全转录组测序检测TBI脑周组织外泌体中环状RNA的表达变化。结果发现231个差异表达的环状RNA,其中155个上调,76个下调。接下来通过生信分析如GO及KEGG分析对外泌体差异表达的环状RNA进行了功能预测。GO分析表明这些RNA分子主要参与神经损伤修复,神经系统发育及神经信号传导相关,这些分子同时主要富集在cGMP-PKG信号通路。CircRNA-miRNA互作网络图揭示了环状RNA作用靶miRNA及可能的功能。本文first研究了大脑创伤外泌体中环状RNA变化,为后续分子机理详细研究提供诸多靶分子,也为大脑创伤的干预医治提供潜在的靶点。云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。
研究背景:利用高通量测序手段,研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达,证明了环状RNA在不同物种中存在。目前,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限,环状RNA数据库circBase中已收录的物种有7个。作为一种重要的模式生物,非洲爪蟾的环状RNA尚未见报道。本文通过云序生物提供的一站式环状RNA测序、环状RNA定量PCR、环状RNA的RNaseR耐受性实验和生物信息学服务于全世界进行了非洲爪蟾环状RNA表达谱的构建,为后续研究脊椎动物环状RNA的生物学功能奠定了基础,非常具有借鉴意义。环状RNA可直接与蛋白质结合。辽宁m6a环状dna
m7G RNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一种修饰。湖北RIP环状平台
对于RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的发展趋势,并非完全是市场的正常反应,因为市场有着阶段性和特殊性。RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体作为重要的新兴产业,仍然在“被看好”阶段,发展前景依然广阔。随着可视化技术的逐步完善与发展,产品间的差异化越来越小,工具整体所需具备的功能也愈发的明晰,使用门槛也在逐年降低。客户对于数据本身的价值越发看重。与工具性减弱相对应的,这正是服务型的加深。中国经济发展进入新周期,在未来增量市场向存量市场过度的过程中,RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的重要性在逐步提升。从资产配置的角度来说,成熟市场模式中,RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体也是重要的配置方向。而当下,技术和消费变化,又给这个领域带来更多机会与挑战。RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体需求非常强,市场也非常大,只是还需要开发。RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的比例高是IPO的极大卖点,该产品的兴起与浪潮无疑是毋容置疑的。现在RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体占20%左右比例,未来很快是50%比例。湖北RIP环状平台
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