保定m1A分析

为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异，RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织，发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化，而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现，AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大，且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目，暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，云序生物m1A检测技术在业界是相对比较成熟的公司。保定m1A分析

RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰，在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的专业者，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。保定甲基化m1A分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其存在于各种细胞系中。

云序生物聚焦于科研前沿领域，针对各类RNA分子、表观遗传学、蛋白质组学等研究热点为广大科研人员提供系统性解决方案。截止2019年5月，公司已取得软件著作权18项，zhuan利2项，软著分别为m6A RNA甲基化、m5C RNA甲基化、chip、circRNA、lncRNA、piRNA、miRNA、mRNA等高通量测序数据分析系统（软件）；上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立，坐落于上海漕河泾新兴技术开发区，专注于表观修饰以及转录组领域，依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等he心技术，集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。

在m1A领域，云序生物是国内一家有文献发表的测序服务平台。2020年8月，云序客户在Plant physiology发表了矮牵牛m1A甲基化修饰文章，其中的m1A测序和相关数据分析均由云序提供。这个新领域的研究进展如何？有哪些新型的方法思路值得我们借鉴呢？小编汇集了近期多篇m1A修饰文章，带大家把握这一领域的前沿进展。1.m1A——矮牵牛mRNA中m1A修饰的动态变化（云序客户文章），2.对不同RNA修饰调控作用的新见解:重新定义转录和翻译之间的桥梁，3.m1A——寡核苷酸质谱法guang泛的应用于体外分析甲基化酶和去甲基化酶。云序技术优势，可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。

1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性，采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化，对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果，捕捉碱基突变的信号，来实现m1A RNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定，为了增加检测灵敏度，作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段，作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中，已知tRNA第9，14和58位会发生m1A RNA修饰，通过这个技术，细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1A RNA修饰，以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1A RNA修饰位点。Nature：真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究。邯郸甲基化m1A

今年9月份，何川教授团队在Nature Methods发布了m1A甲基化修饰。保定m1A分析

m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序生物作为国内较早做m1A的科研平台，至今用户已发表10+篇m1A相关文章，其中多篇影响因子超过10分，成为国内m1A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广，包括编码mRNA和非编码lncRNA，circRNA，microRNA等分子。保定m1A分析