技术简介 DNA甲基化能控制基因表达,因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用,并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关,是表观遗传学研究的热点。 云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力,我们提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。ctDNA甲基化与ai症发展各时期关系密切,特别是ai症早期。中国台湾技术表观遗传组测序
CUT&Tag 是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,相较于传统的 ChIP-Seq 具有以下优点:省时高效、所需的细胞量少、背景信号低、可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义。 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。湖南表观遗传组测序是什么ctDNA甲基化基因的有效性(AUC:0.816)远高于传统分子标志物AFP(AUC:0.969)。
案例2:解析转录因子结合 原文:Cell-type specific and combinatorial usage of diverse transcription factors revealed by genome-wide binding studies in multiple human cells 期刊:Genome Research 影响因子:10.10 本文通过ChIP测序系统性地调查了11种不同类型人类细胞中3种转录因子(CTCF、RNAPII和MYC)与基因组的结合情况。结果表明:CTCF主要结合在基因间区,而RNAPII和MYC则偏向于结合在启动子区。CTCF结合位点在不同类型细胞中往往没有多大变化,而MYC的结合则呈现强烈的细胞特异性。MYC和RNAPII在很多区域共定位,并具有很多共同的靶基因。此外,通过整合转录组测序数据发现:转录因子结合与潜在靶基因的表达正相关,多个转录因子的组合结合,尤其是MYC和RNAPII的同时结合与基因高表达有着很强的关联性。
由于通常的活检技术不能够描述分子特性,因此胰腺ai和胆道ai患者通常缺少个性化的治疗方案。而游离的DNA测序能够帮助这部分人群进行医疗。在Eric A. Collisson教授的研究中,他们分析了26名患者tumsor中的54个基因。除了9名患者测序失败,剩下的17名患者中,90.3%的tumsor突变都能够在ctDNA中发现。其正确率为97.7%,灵敏度为92.3%,特异性为100%。同时,他们发现,ctDNA与tumsor标记动态是具有相关性的。因此,可以在胰腺cancer和胆道cancer患者中,通过ctDNA测序的方法,来确定患者的tumsor基因型,从而为患者提供准确的靶向疗法。但新的研究表明:无论是在正常体细胞还是ai细胞中,都存在大量染色体外环状DNA。
技术简介 DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,一种新的DNA甲基化修饰类型—DNA-6mA甲基化已经成为表观遗传学领域的研究热点。 云序生物率先开发了DNA-6mA测序技术—6mA-IP-seq。其原理类似于MeDIP的免疫共沉淀测序技术,利用特异性抗体富集6mA的片段,扩增后进行高通量测序及甲基化分析,以较小的数据量,快速地绘制全基因组DNA甲基化水平的图谱。专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法。中国香港云序生物表观遗传组测序分析
通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。中国台湾技术表观遗传组测序
早在去年 5 月,中国本土公司近岸蛋白质(NOVOPROTEIN)便公开了该方法替代 ChIP-Seq 的可能性与原料 ChiTagTM 酶(一种 Protein A 与 Tn5 融合蛋白)的技术原理(图1),展示了中国生物技术公司已经走出对国外公司的简单模仿,在某些领域的自主创新走在了世界的前列。Henikoff 博士的文章进一步展示了 ChiTag (Chromatin Immuno-Tagment) 酶在解决蛋白质-DNA 相互作用的巨大潜力。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。中国台湾技术表观遗传组测序