朝阳区m1A环状RNA测序

为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异，RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织，发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化，而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现，AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大，且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目，暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰。朝阳区m1A环状RNA测序

近日，云序客户分别在肝ai和胃ai中进行了m6A和m5C RNA甲基化的全转录组测序（circRNA、lncRNA和mRNA），其中在肝ai中进行的m5C测序数据发表了三篇表达谱的文章，实现了一次测序，三套数据，三项成果的“大满贯”；随之在胃ai中进行的m6A测序数据也发表两篇表达谱文章。真正体现了一次测序三套数据（circRNA、lncRNA和mRNA），多项成果，超高性价比，短平快发表高分文章。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。太原m1Am1A-MAP揭示核编码和线粒体编码转录本上不同类型的m1A甲基化组。

为了研究人细胞转录组中的m1A修饰，伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其guang泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段，发展了“m1A-ID-seq” 一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术，该研究成功实现了人细胞系全转录组水平的高分辨率m1A检测，鉴定出901个含有m1A修饰的转录本，并且发现m1A呈现强烈的5’非转录区分布特异性。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，

何川教授助力m1A甲基化修饰研究。2019年9月23日，美国芝加哥大学Bryan C. Dickinson团队与何川团队在Nature Methods上发表“Evolution of a reverse transcriptase to map N1-methyladenosine in humanmessenger RNA”研究成果，该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台，可快速选择逆转录酶，使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点，并使其发生突变，从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测，在测序过程中产生突变标记，终实现单碱基识别m1A，为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。继m6A、m5C、m1A之后，云序隆重推出多款RNA新修饰类型。

2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测，发现了740个m1A修饰位点，其中473个位点位于mRNA和lncRNA，大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库，作者还排除了假阳性结果。另外，作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关，且这种正相关性在cap+1位置上更xian著，但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析，作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外，作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物，也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。生物化学表征分析显示：ALKBH1在体外或者细胞内对tRNA中的m1A甲基化都具有去甲基化活性。朝阳区m1A全转录组测序

伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其存在于各种细胞系中。朝阳区m1A环状RNA测序

在m1A领域，云序生物是国内一家有文献发表的测序服务平台。2020年8月，云序客户在Plant physiology发表了矮牵牛m1A甲基化修饰文章，其中的m1A测序和相关数据分析均由云序提供。这个新领域的研究进展如何？有哪些新型的方法思路值得我们借鉴呢？小编汇集了近期多篇m1A修饰文章，带大家把握这一领域的前沿进展。1.m1A——矮牵牛mRNA中m1A修饰的动态变化（云序客户文章），2.对不同RNA修饰调控作用的新见解:重新定义转录和翻译之间的桥梁，3.m1A——寡核苷酸质谱法guang泛的应用于体外分析甲基化酶和去甲基化酶。朝阳区m1A环状RNA测序

上海云序生物科技有限公司致力于商务服务，是一家服务型公司。公司业务分为RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体等，目前不断进行创新和服务改进，为客户提供良好的产品和服务。公司注重以质量为中心，以服务为理念，秉持诚信为本的理念，打造商务服务良好品牌。云序生物凭借创新的产品、专业的服务、众多的成功案例积累起来的声誉和口碑，让企业发展再上新高。