LC-MS/MS检测核酸修饰水平实验原理: 云序生物建立了一种基于 LC-MS/MS 平台的核酸修饰分析方法,定量 4类 DNA 修饰(5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA)和 9 类 RNA 修饰(m5C、 m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C),为表观遗传研究提供理想的技术平台。 液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物,并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS 法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法;而将 LCMS/MS 法与一定的样品前处理方法相结合,能够更好地对各类生物样品中的 DNA/RNA 修饰进行检测。m1A 环状RNA测序,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术。安徽云序测序RNA甲基化
m7G lncRNA测序 m7G RNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一种修饰(N7-methylguanosine,m7G)。研究表明,m7G RNA甲基化修饰存在于各类分子中,包括:mRNA 5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)。m7G RNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录、miRNA的生物合成和生物学功能、tRNA稳定性、18S rRNA的核内加工及成熟。m7G RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化,近两年高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。重庆云序生物测序云序生物对m5C RNA-Seq实验每一步骤均设有关键质控,保证客户得到更佳数据。
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!
云序优势 适用于血清血浆等微量样品: 此法减少DNA损失,并保留原始表达量,不同环状DNA间表达量比较更准确 专业的生物信息学分析: 专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。 一站式服务: 客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求 样品类型: 血清血浆。 样品量: 血清血浆:5mL 样品运输及保存: EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。云序采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。
m6A环状RNA测序:近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A,即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰(N6-methyladenosine,m6A)。研究发现,m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰, m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。 目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术,云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务,技术原理如下: 将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序。样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。新疆研究测序
云序生物利用启动子区(TSS-2000 ~ TSS+2000)富集峰对应的基因进行通路分析。安徽云序测序RNA甲基化
样本要求: 样品类型: 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量: a) 细胞:2×107 b) 组织:100 mg-1 g c) RNA:30-300 μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。安徽云序测序RNA甲基化
上海云序生物科技有限公司主要经营范围是商务服务,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司自成立以来,以质量为发展,让匠心弥散在每个细节,公司旗下RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体深受客户的喜爱。公司注重以质量为中心,以服务为理念,秉持诚信为本的理念,打造商务服务良好品牌。云序生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。