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2'-o-甲基化样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a) 细胞:1×108 b) 组织:500 mg - 5g c) RNA:100 μg - 300 μg (OD260/280:1.6-2.3; RNA无明显降解) 样品运输及保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云序生物拥有BD Rhapsody™单细胞免疫组测序平台。山东修饰测序

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ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!平台测序全转录组云序采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。

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LC-MS/MS检测核酸修饰水平实验原理: 云序生物建立了一种基于 LC-MS/MS 平台的核酸修饰分析方法,定量 4类 DNA 修饰(5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA)和 9 类 RNA 修饰(m5C、 m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C),为表观遗传研究提供理想的技术平台。 液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物,并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS 法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法;而将 LCMS/MS 法与一定的样品前处理方法相结合,能够更好地对各类生物样品中的 DNA/RNA 修饰进行检测。

核糖体印迹测序又称Ribosome profiling,或Ribo-seq,是运用测序手段研究翻译组学的一种主要的技术手段。该技术通过使用翻译抑制剂使正在翻译的mRNA序列固定在核糖体上。加入核酸酶处理不受核糖体保护的mRNA,分离核糖体并提取纯化核糖体上未被消化的短片段mRNA(大约30nt),进而获得正在翻译的mRNA序列。这项技术可获得实时全转录组正在翻译的序列信息,使研究者能从分子水平检测蛋白组的翻译情况,并了解蛋白质的翻译水平及翻译过程,在蛋白翻译机制的研究领域中有广阔的应用前景。适用于任何物种:可以检测几乎任何动植物的环状RNA。

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案例1:拟南芥花叶根组织m6A RNA甲基化谱 原文:Transcriptome-wide high-throughput deep m6 A-seq reveals unique differential m6 A methylation patterns between three organs in Arabidopsis thaliana 期刊:Genome Biology 影响因子:13.21 西北农林科技大学联合中科院和普渡大学,借助m6A RNA甲基化测序技术,对比拟南芥花,叶,根组织中(每种组织有两个生物学重复)m6A RNA甲基化情况。结果发现检测组织中m6A RNA甲基化修饰程度比人类高10%左右,占转录组的83%。根据注释信息,绘制富集峰在不同基因组特征上的比例图。浙江测序mRNA

在RIP-Seq中,富集峰表示全部活跃转录的区域(相对于对照IgG)。山东修饰测序

云序优势 适用于血清血浆等微量样品: 此法减少DNA损失,并保留原始表达量,不同环状DNA间表达量比较更准确 专业的生物信息学分析: 专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。 一站式服务: 客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求 样品类型: 血清血浆。 样品量: 血清血浆:5mL 样品运输及保存: EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。山东修饰测序

上海云序生物科技有限公司主要经营范围是商务服务,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司自成立以来,以质量为发展,让匠心弥散在每个细节,公司旗下RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体深受客户的喜爱。公司注重以质量为中心,以服务为理念,秉持诚信为本的理念,打造商务服务良好品牌。云序生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。

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