开发一种新药的过程可能是漫长、复杂和不确定的，但从社会、科学和经济的角度来看，它也可能是高回报的。高通量筛选(HTS)已经成为药物发现的主要工具。，向大家介绍目前用于靶标确认的几种HTS方法，主要分为两大类:生化水平和细胞水平。生化水平分析包括比率荧光法（FA/FP）、荧光共振能量转移（FRET）、时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)等；细胞水平的分析包括细胞活力、报告基因、第二信使和高内涵成像等。生化筛选利用纯化的目标蛋白，在体外测定配体的结合或酶活性的抑制。这些检测通常在384孔板中以竞争的形式进行，其中所研究的化合物必须取代已知的配体或底物。荧光法由于其使用简便、灵敏度高和灵活性强等特点，广受科研人员的欢迎，主要有比率荧光法（FA/FP）、荧光共振能量转移（FRET）、时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)。高通量筛选技术的优点。四川基因组学高通量筛选
高通量药物筛选基于发现的靶点，构建合适的筛选模型，在分子水平和细胞水平上建立和优化各类稳健的筛选方法，以高密度的微孔板为实验载体，通过自动化设备或系统完成包括体系构建，孵育以及检测在内的整个实验过程，从而实现多个化合物库中数以千万的化合物的高通量筛选，并通过大量的数据分析筛选出潜在有价值的目标化合物。高通量药物筛选具有微量、快速、灵敏、准确的特点，是当代新药发现技术的重大进步，使全球各大医药公司和研究机构加快了药物研发的进程。云南细胞水平高通量筛选高通量筛选的主要目的是什么。
高通量筛选是药物研发的一个重要手段，然而研究中发现一些化合物在不同类型靶点筛选中均表现出阳性结果，这类化合物称为“频繁命中化合物”（Frequent hitters）。根据筛选结果的有效性，频繁命中化合物可以大致分为两类，一是能与许多不同类型靶点成键结合的混乱化合物（Promiscuous compound）；二是通过干扰实验条件而在多个实验中呈现出阳性结果的假阳性化合物（False positive）。虽然混乱化合物可能成为多药理作用的研究起点，但考虑其低选择性容易与其他蛋白发生反应从而导致潜在的毒副作用，因此这类化合物通常不作为新药物研发的优先；而假阳性化合物产生机制较为复杂，根据现有的研究主要可以分为：胶体聚集化合物、自荧光化合物、荧光酶抑制剂和化学易反应化合物。
正如之前提到，在高通量筛选中Assay的检出方法有很多，用于衡量酶活性多的当属于荧光检出法和吸光度检出法。这两种方法都能非常便捷的与高通量进行匹配。但是这两种检出方法也有不适用的场景，比如吸光度检出法，在终点法测定（endpointassay）时，如果化合物库的吸收低于~410nm，实验的背景吸收会引入假阳性（false-positive）和假阴性（false-negative）结果。虽然假阳性结果可以通过动力学Assay或者验证Assay来解决，但是由于微量定量板有位于340~410nm的强吸收，所以仍旧会导致Z因子降低，直接结果就是较弱活性的苗头化合物将很难被筛选出来。而对于荧光检出法而言，自发荧光化合物库或者具有光敏特性的化合物库同样会遇到假阳性和假阴性结果。在某种程度上，选择合适的检出方法可以减少甚至避免上述问题，比如使用更长波段的光源，对于荧光检出来说，>500nm会是比较好的选择。微流控高通量筛选技术。
琼脂平板筛选法，对突变体间差异可视化较弱，适用于突变库的初步筛选，筛选后的突变体仍需要其他检测方法如微孔板法进行准确定量。数字影像分光光度计在琼脂平板筛选方法中的应用使琼脂平板法的灵敏度提高且通量达到10^5克隆/d，若可根据目标酶或代谢产物的特性建立琼脂平板筛选方法，则无需使用依赖复杂仪器设备的超高通量筛选法。平板筛选法是微生物在平板固体培养基上进行生殖反应，从而反应出来的性状。微孔板筛选方法微孔板筛选方法通过检测微孔板中底物或目标产物所引起的吸光度或荧光变化对其进行定量分析，可以保证筛选的精确性和灵敏度，是目前常用的筛选方法。根据荧光或吸光度精确检测目标产物的微孔板(Microtiterplate，MTP)筛选方法应运而生，并已广泛应用于酶和细胞工厂的定向改造中。但微孔板筛选法存在通量低、操作耗时等缺点。微孔板筛选法，可以理解成非常小的摇瓶，是微生物在液体环境中反应出来的性状。药物高通量筛选系统。河南酶高通量筛选
传统高通量筛选设备。四川基因组学高通量筛选
高通量筛选的实验方法必须具备条件稳定，样本之间差异性小，容易检测，且可以大批量同时检测等特性。除了以上介绍的三种较为常用的方法之外，第二信使检测、细胞活力检测等方法也是常用的细胞水平的检测手段。化合物库的使用在筛选前期也起着十分重要的作用。在化合物未知的情况下，数量足够大的化合物库可增加识别目标的概率；不同细分用途的化合物库，则能进一步整合具有某项作用的尽可能多的化合物。MCE对不同方向、不同种类、性质不同的化合物做了详细分类，如生物活性化合物库、FDA上市库、天然产物库等可以供不同需求的科学家选择。随着技术的发展，MCE化合物库数量会越来越多，分类也越来越精细，这将节约前期筛选合适化合物所需的时间。此外，MCE还可以根据你的不同需求提供定制库~四川基因组学高通量筛选
