2.环状RNA定量PCR及RNase R耐受实验,验证环状RNA的表达和结构 为了验证测序结果的准确性,研究人员随机选取了8条差异表达的环状RNA,利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测和RNase R耐受性实验。所有环状RNA的表达都能够被定量PCR实验检测到,并且定量PCR结果与测序结果趋势一致,表明环状RNA测序结果准确性非常高。所有环状RNA都能抵抗RNase R的消化,进一步证实了这些RNA的环形结构。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。环状RNA可直接与蛋白质结合。山东外泌体环状RNA修饰
研究背景: 造血干细胞(HSC)自我更新和分化之间的平衡打破将导致骨髓衰竭及恶性血液tumour发生。然而,HSCs如何维持其静止状态并避免I型干扰素(IFN)介导能量耗竭、细胞凋亡仍未可知。本文一种名为cia-cGAS的环状RNA,它在长效(LT)-HSCs细胞核中高度表达。小鼠Cia-cGAS缺陷将导致I型IFN在骨髓中高表达并伴随静息LT-HSC数量明显减少。在稳态条件下,cia-cGAS在细胞核中通过结合DNA传感器cGAS以阻断其合酶活性,由此保护静息LT-HSC免于被cGAS介导耗尽凋亡。此外,cia-cGAS与线性cGAS相比,与cGAS结合亲和力更强,由此抑制cGAS介导LT-HSCs中I型IFN产生。本文揭示了一个新型环状RNA——cia-cGAS可结合DNA敏感的cGAMP合酶cGAS并抑制其活性,调控长效造血干细胞(LT-HSC)静息状态。新疆m5c环状研究可以翻译成蛋白质,但大部分是非编码RNA。
为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况,研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序,共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析,发现环状RNA可分为5类,其中基因间(intragenic)产生的环状RNA占大多数。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现62条环状RNA差异表达,这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性,研究人员挑选了16条环状RNA,利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测。
技术简介 环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生和发展密切相关。此外,环状RNA不易降解,能在血浆、唾液等体液中稳定存在,可以作为新型疾病分子标志物。当前,科研人员对这一功能性分子仍知之甚少,可见对其展开深入的研究是非常有必要的,一场科研的竞赛已悄然开始!云序生物提供的环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit,去除样本中的线性mRNA和rRNA,保留纯化后的环状RNA,因此测序获得的环状RNA有效数据量是其他测序服务供应商远远无法企及的,帮助客户以较低的成本检测到更多的环状RNA。此外,Cloudseq CircRNA Enrichment Kit覆盖几乎全部已知物种,对环状RNA的研究将不再局限于人、小鼠、大鼠等常见物种。m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。
作为一种普遍存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种的环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。云序生物客户发表的这项成果是全世界first篇对小麦环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何简单地通过环状RNA测序,环状RNA定量PCR和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。安徽ac4c环状RNA测序
circRNA主要由外显子构成,少部分由内含子环化形成。山东外泌体环状RNA修饰
作为一种广fan存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA的研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种中环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。 云序生物客户发表的这项成果是全世界di一篇对非洲爪蟾环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何通过环状RNA高通量测序和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。山东外泌体环状RNA修饰
上海云序生物科技有限公司主要经营范围是商务服务,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。云序生物致力于为客户提供良好的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,一切以用户需求为中心,深受广大客户的欢迎。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于商务服务行业的发展。云序生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。