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云序优势 适用于任何物种: 可以检测几乎任何动植物的环状RNA。 适用于降解样品: 可以检测部分降解的样品的环状RNA。 有效数据量高: 通过商业化kit富集环状RNA,极大地提高了有效数据比例。 性价比高:能够以较低的成本检测更多的环状RNA。 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。 专业化的生物信息学分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求。云序生物环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit。山西环状文章

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1.环状RNA测序,高通量筛选AZ处理相关环状RNA 各类农药(除草剂、杀虫剂和杀菌剂三类)对非洲爪蟾产生的包括神经发育、性腺发育等方面的伤害作用,使得非洲爪蟾作为农药污染监测的模式生物备受青睐。莠去津(Atrazine, AZ)是地下水和地表水中常见的环境内分泌干扰物之一。研究人员在Nieuwkoop-Faber(NF)第47阶段(孵化后第13天),将来自一对成年配偶的蝌蚪随机分为AZ处理和对照两组,随后收集雄性非洲爪蟾的睾丸组织(AZ处理组vs.对照组:3 vs.3)用于检测非洲爪蟾中所有环状RNA的表达情况,检测一共发现了68575条环状RNA。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现405条环状RNA差异表达(包括44条上调和361条下调),这暗示着这些环状RNA可能在AZ污染过程中发挥作用。湖北环状结果环状RNA哪家做得好,还是上海松江区的云序生物比较好。

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云序环状RNA课题技术服务四大模块: 一、 环状RNA筛选: 1.1 circRNA测序 1.2全转录组测序(同时检测circRNA、lncRNA、mRNA) 二、环状RNA验证 2.1 qRT-PCR 对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务,包括引物设计与表达鉴定。 2.2 Sanger测序与RNase R酶耐受实验 对选定的环状RNA分子进行反式剪切位点引物设计,扩增后Sanger测序验证环状;使用RNase R酶处理环状RNA分子,验证环状RNA分子稳定性。 三、 CircRNA功能机制研究 3.1 RIP测序/qPCR 针对目标蛋白抗体把蛋白-RNA复合物沉淀下来,并对复合物上的RNA进行测序或对目标RNA进行qRCR表达分析。

研究背景: 造血干细胞(HSC)自我更新和分化之间的平衡打破将导致骨髓衰竭及恶性血液tumour发生。然而,HSCs如何维持其静止状态并避免I型干扰素(IFN)介导能量耗竭、细胞凋亡仍未可知。本文一种名为cia-cGAS的环状RNA,它在长效(LT)-HSCs细胞核中高度表达。小鼠Cia-cGAS缺陷将导致I型IFN在骨髓中高表达并伴随静息LT-HSC数量明显减少。在稳态条件下,cia-cGAS在细胞核中通过结合DNA传感器cGAS以阻断其合酶活性,由此保护静息LT-HSC免于被cGAS介导耗尽凋亡。此外,cia-cGAS与线性cGAS相比,与cGAS结合亲和力更强,由此抑制cGAS介导LT-HSCs中I型IFN产生。本文揭示了一个新型环状RNA——cia-cGAS可结合DNA敏感的cGAMP合酶cGAS并抑制其活性,调控长效造血干细胞(LT-HSC)静息状态。环状RNA可通过RNA介导间接与蛋白质发生关联。

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为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况,研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序,共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析,发现环状RNA可分为5类,其中基因间(intragenic)产生的环状RNA占大多数。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现62条环状RNA差异表达,这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性,研究人员挑选了16条环状RNA,利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测。环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域新的研究热点。辽宁m1A环状RNA测序

m6A环状RNA测序,云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。山西环状文章

研究一:环状RNA分子筛选及验证 为探索造血干细胞功能相关的circRNA分子,作者比较了小鼠不同造血干细胞(LT-HSC,ST-HSC和MPPs)中全转录组变化情况,找出了156种明显性差异表达的circRNA分子,其中49种在LT-HSC中高表达。RNase R及qPCR实验证实其中9种为真实LT-HSC中高表达环状RNA 分子。为有效筛选造血干细胞相关的circRNA分子,作者通过体内circRNA干扰实验,发现只有干扰Cia-cGAS后才能明显影响小鼠体内造血干细胞亚群分布,并表现为LSK祖细胞数量明显增加,与此同时LT-HSC细胞数量明显减少。因此,作者结合转录组数据以及体内、体外验证实验,锚定Cia-cGAS分子进行后续分子机制研究。山西环状文章

上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。公司自创立以来,投身于RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,是商务服务的主力军。云序生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。云序生物始终关注商务服务市场,以敏锐的市场洞察力,实现与客户的成长共赢。

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