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PNAS| 8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质翻译 发表时间:2018年4月17号 影响因子:9.412 PNAS杂志发表了来自国家老年医学中心、北京医院研究的一篇有关O8G氧化修饰改变哺乳动物细胞中蛋白合成的研究成果。文章题目为“Transcriptional mutagenesis mediated by 8-oxoG induces translational errors in mammalian cells”。 哺乳动物细胞内形成的活性氧可以在mRNA中产生8-oxoG修饰,这一氧化修饰在基因表达过程中会导致碱基错配。本研究首先构建了一种基于超敏荧光素酶Gluc(Gussia luciferase)的报告基因检测系统,通过第二代测序技术发现当RNA中8-oxoG含量增加使U-to-G位点增加,从而诱导表达淀粉样前体蛋白的淀粉样β肽(老年痴呆的重要标志物)。该研究结果表明,8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质合成。本论文的发表为深入氧化修饰与蛋白合成间的分子机理提供了全新的研究思路!m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。江西6mADNA甲基化

研究表明,RNAm6A修饰影响mRNA的转录、定位、翻译、稳定性、剪接和核输出。然而,转录组m6A谱及其在白菜热胁迫中的潜在生物学作用尚缺乏足够的资料。通过MeRIP-seq获得白菜中RNA m6A修饰的first转录组全谱。同时,通过分析Input测序数据获得转录组数据。发现在正常组(CK)和热应激组(T43)中鉴定出11252个m6A共有峰和9729个含有m6A的共有基因。且CK组和T43组中,m6A峰均在3’UTR区高度富集。大约80%的基因有一个m6A位点。m6A峰的共识基序为AAACCV (V: U/A/G)。此外,关联分析发现m6A的甲基化程度与转录水平存在一定的相关性,说明m6A在基因表达中起一定的调控作用。植物中m6A修饰的研究主要集中在拟南芥的生长发育上。然而,拟南芥是一种盐敏感模式植物。因此,有必要对m6A修饰在高耐盐作物的盐胁迫响应中的作用进行研究。甜高粱是一种能源和饲料作物,非常适合在盐碱地生长。北京甲基化差异将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育。

mRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内首批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务,利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA的片段上 m6A 修饰的信号干扰,选择性地获取 mRNA 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA的 片段进行反转录建库和高通量测序,可为后续的生物信息学分析提供丰富的数据,进而揭示差异性 m6Am 修饰位点的特征及其可能的生物学功能,为您的科研课题提供强劲的助力。 云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。

m6A修饰在植物中是必不可少的。在这里,作者证明了在水稻中表达转基因人RNA去甲基化酶FTO可以使温室条件下的粮食产量增加3倍以上。在田间试验中,转基因FTO在水稻和马铃薯中的表达使产量和生物量增加了约50%。此外,FTO的存在促进了根分生组织细胞增殖和分蘖芽的形成,提高了光合效率和抗旱性,但对成熟细胞大小、茎分生组织细胞增殖、根直径、株高或倍性没有影响。FTO介导了植物RNA中大量的m6A去甲基化(在poly(A) RNA中约7%的去甲基化,在非核糖体核RNA中m6A下降约35%),诱导染色质开放和转录激huo。因此,调控植物RNA m6A甲基化是一种很有前景的策略,可明显提高植物的生长和作物产量。包括:mRNA 5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)。

云序特色 √ j较全产品线:可针对性地检测不同类型RNA分子的O8G氧化; √ 特异性高:特异性富集和检测O8G氧化的 RNA的片段; √ 全转录组覆盖:全转录组范围的RNA O8G氧化检测; √ 全物种检测:可以检测几乎任何动植物的O8G氧化; √ 专业化的生信分析:强大的生信团队,专业的O8G氧化数据分析; 产品分类 O8G 全转录组测序:同时检测O8G氧化的环状RNA,LncRNA和mRNA; O8G 环状RNA测序:检测O8G氧化的所有环状RNA; O8G LnRNA测序:同时检测O8G氧化的LncRNA和mRNA; O8G mRNA测序:检测O8G氧化的所有mRNA;目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。河北甲基化修饰

对m6A RNA甲基化,目前流行的检测手段为m6A-Seq技术,适用于m6A RNA甲基化谱研究。江西6mADNA甲基化

技术简介 2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下,核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。在哺乳动物、酵母、植物、病 毒等物种中普遍存在。已有研究表明,2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。从结构上,2’-O-RNA甲基化通过提高核苷酸的疏水性,从而增强其稳定性。已有研究表明,2’-O-RNA甲基化影响mRNA与蛋白的结合、调控rRNA翻译效率、参与tRNA识别等生物过程。近年来,2’-O-RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化,高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。江西6mADNA甲基化

上海云序生物科技有限公司主要经营范围是商务服务,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司业务分为RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等,目前不断进行创新和服务改进,为客户提供良好的产品和服务。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于商务服务行业的发展。云序生物凭借创新的产品、专业的服务、众多的成功案例积累起来的声誉和口碑,让企业发展再上新高。

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