环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20篇以上,“云序制造”越来越多的出现在科研论文当中。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的公司,拥有先进的技术,专业的团队,精密的仪器。circRNA与白血病、恶性胶质liu、胃ai、肝ai等疾病的发生、发展密切关联。河南m7G环状研究
研究一:环状RNA分子筛选及验证 为探索造血干细胞功能相关的circRNA分子,作者比较了小鼠不同造血干细胞(LT-HSC,ST-HSC和MPPs)中全转录组变化情况,找出了156种明显性差异表达的circRNA分子,其中49种在LT-HSC中高表达。RNase R及qPCR实验证实其中9种为真实LT-HSC中高表达环状RNA 分子。为有效筛选造血干细胞相关的circRNA分子,作者通过体内circRNA干扰实验,发现只有干扰Cia-cGAS后才能明显影响小鼠体内造血干细胞亚群分布,并表现为LSK祖细胞数量明显增加,与此同时LT-HSC细胞数量明显减少。因此,作者结合转录组数据以及体内、体外验证实验,锚定Cia-cGAS分子进行后续分子机制研究。吉林m6a环状RNA修饰m6A环状RNA测序,云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。
胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。
作为一种普遍存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种的环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。云序生物客户发表的这项成果是全世界first篇对小麦环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何简单地通过环状RNA测序,环状RNA定量PCR和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。上海环状RNA哪家做得好,还是松江区的云序生物比较好。
环状RNA是什么? 环状RNA(circRNAs)是一类不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。目前发现的circRNAs主要来源于基因外显子exon,但还有其他类型,比如来源于内含子intron,基因间intergenic,反义链antisense,重叠区sense overlapping。首先需要确定好研究物种,疾病模型,样品类型等基本信息。接下来,通过高通量手段即RNA-seq(云序提供全转录组-seq或circRNA-seq)或文献报道,筛选差异表达的circRNA。如果想短平快的发表3-5分的文章,那么表达谱分析显得再合适不过了。如果有大量的临床样本,那么做分子标志物也是很easy的,思路和表达谱分析相似如下图展示,不过多了临床样本的统计和验证。(比如KM曲线,ROC曲线,PAM分析等等)环状 RNA 可以起到 microRNA 海绵的作用。江西ac4c环状研究
云序生物对m6A RNA-seq实验每一步骤均设有关键质控。河南m7G环状研究
技术简介 环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生和发展密切相关。此外,环状RNA不易降解,能在血浆、唾液等体液中稳定存在,可以作为新型疾病分子标志物。当前,科研人员对这一功能性分子仍知之甚少,可见对其展开深入的研究是非常有必要的,一场科研的竞赛已悄然开始!云序生物提供的环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit,去除样本中的线性mRNA和rRNA,保留纯化后的环状RNA,因此测序获得的环状RNA有效数据量是其他测序服务供应商远远无法企及的,帮助客户以较低的成本检测到更多的环状RNA。此外,Cloudseq CircRNA Enrichment Kit覆盖几乎全部已知物种,对环状RNA的研究将不再局限于人、小鼠、大鼠等常见物种。河南m7G环状研究
上海云序生物科技有限公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,拥有一支专业的技术团队。高通量测序,测序合成,科研,技术服务是上海云序生物科技有限公司的主营品牌,是专业的上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。公司,拥有自己**的技术体系。公司坚持以客户为中心、上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。市场为导向,重信誉,保质量,想客户之所想,急用户之所急,全力以赴满足客户的一切需要。上海云序生物科技有限公司主营业务涵盖RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针,赢得广大客户的支持和信赖。