2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰。房山区研究m1A
企业使命:把握科技前沿,专业贴心服务,助力科技创新 企业愿景:专注基因科技,驱动未来健康 经营理念:专业为he心、市场为导向、创新为基础、服务为使命 专业,协作,创新,责任,品德 管理理念:团结协作,互助友爱,追求zhuo越 行为准则:诚信,专注,效率,共赢,尊重 上海市松江区莘砖公路518号18号楼2楼 研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。 河北区m1A分析伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其存在于各种细胞系中。
云序生物聚焦于科研前沿领域,针对各类RNA分子、表观遗传学、蛋白质组学等研究热点为广大科研人员提供系统性解决方案。截止2019年5月,公司已取得软件著作权18项,zhuan利2项,软著分别为m6A RNA甲基化、m5C RNA甲基化、chip、circRNA、lncRNA、piRNA、miRNA、mRNA等高通量测序数据分析系统(软件);上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等he心技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。
为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异,RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织,发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化,而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现,AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大,且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目,暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。
MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供,是在已发表实验方法的基础上开发而来,方法简述如下:片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠(Thermo Fisher)在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂(Thermo Fisher)进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒(NEB)建库,并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰。河北区m1A分析
云序m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段。房山区研究m1A
自2010年以来,RNA表观遗传学概念提出后,随后几年这一领域的研究便如火如荼的开展起来,同时也取得了zhuo越的成果,其中包括m6A,m5C RNA甲基化修饰等,而我们要来谈一谈的是近发表在Molecular Cell (IF:14.714)上的一篇关于m1A RNA甲基化的文章,这是一类新型RNA修饰,想必大家也迫不及待地想看看科研研究成果了吧,话不多说,让我们来一探究竟。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。房山区研究m1A
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