在m1A领域,云序生物是国内一家有文献发表的测序服务平台。2020年8月,云序客户在Plant physiology发表了矮牵牛m1A甲基化修饰文章,其中的m1A测序和相关数据分析均由云序提供。这个新领域的研究进展如何?有哪些新型的方法思路值得我们借鉴呢?小编汇集了近期多篇m1A修饰文章,带大家把握这一领域的前沿进展。1.m1A——矮牵牛mRNA中m1A修饰的动态变化(云序客户文章),2.对不同RNA修饰调控作用的新见解:重新定义转录和翻译之间的桥梁,3.m1A——寡核苷酸质谱法guang泛的应用于体外分析甲基化酶和去甲基化酶。Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A。保定m1AlncRNA测序
案例1:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,原文:The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA,期刊:Nature 影响因子:41.456,芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文,该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行细致的分析,揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性,在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。昌平区遗传m1ARNA甲基化富集峰分布图。
为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异,RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织,发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化,而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现,AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大,且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目,暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。
m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序生物作为国内较早做m1A的科研平台,至今用户已发表10+篇m1A相关文章,其中多篇影响因子超过10分,成为国内m1A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广,包括编码mRNA和非编码lncRNA,circRNA,microRNA等分子。m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰。
近日,云序客户分别在肝ai和胃ai中进行了m6A和m5C RNA甲基化的全转录组测序(circRNA、lncRNA和mRNA),其中在肝ai中进行的m5C测序数据发表了三篇表达谱的文章,实现了一次测序,三套数据,三项成果的“大满贯”;随之在胃ai中进行的m6A测序数据也发表两篇表达谱文章。真正体现了一次测序三套数据(circRNA、lncRNA和mRNA),多项成果,超高性价比,短平快发表高分文章。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。生物在线,丁香通,生物器材,搜狐网均有云序的文章。甲基化m1A分析
m6A/m1A/m5C RNA甲基化定量检测试剂盒。保定m1AlncRNA测序
为顺应商业变革和消费升级趋势,鼓励运用大数据、云计算、移动互联网等现代信息技术,促进上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。等跨界融合,形成更多流通新平台、新业态、新模式。引导更多平台以数据赋能生产企业,促进个性化设计和柔性化生产,培育定制消费、智能消费、信息消费、时尚消费等商业新模式。由于国内经济结构正在向产业互联网方向步进,数字化的概念也正在被普及。诸如“经济数字化、互联网数字化......”,因此由数字化推动的销售产业意义和商业价值更为人所关注。尤其是在产业浪潮下,面对互联网红利落后的窘况,新科技新数字所引导的销售或许是一场变革。不少行业在为提升服务型价值的布局上,采取了专业培训和技术平台并驾齐驱的方式。在这个维度产生交互和迭代,继而改变产业的流程、场景,使之系统化、标准化、智能化。我认为这是服务型进化的重要方向。坚持以供给侧结构性改进为主线,明确RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体发展方向,推动高质量发展重点任务落实,努力布局优化、竞争力强的服务产业新体系,不断满足RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体升级为实现经济高质量发展提供重要支撑。保定m1AlncRNA测序
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