云序生物m1AlncRNA测序

此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的，该课题组利用m1A-seq & RNA-seq（本实验云序提供）技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析，发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平，定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。云序m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体，可特异性富集m1A修饰片段。云序生物m1AlncRNA测序

2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测，发现了740个m1A修饰位点，其中473个位点位于mRNA和lncRNA，大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库，作者还排除了假阳性结果。另外，作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关，且这种正相关性在cap+1位置上更xian著，但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析，作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外，作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物，也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。沧州m1Apri-miRNA测序m1A-MAP揭示核编码和线粒体编码转录本上不同类型的m1A甲基化组。

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠（Thermo Fisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（Thermo Fisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。

为了探寻m6A修饰与结直肠ai（CRC）的糖酵解代谢的相关性，采用qPCR检测结直肠ai患者体内脱氧葡萄糖吸收（FDG uptake）和m6A修饰相关酶表达的情况，发现Mettl3（m6A甲基化转移酶）的表达与FDG摄取存在明显的相关性。同时检测到在CRC体内Mettl3高表达和葡萄糖代谢强烈保持一致，那么在结直肠ai患者体内FDG和Mettl3的变化是否影响甲基化整体水平的变化呢？作者采用多种方法检测高FDG CRC和低FDG CRC患者体内甲基化水平，结果表明m6A修饰水平在这些FDG摄取较高的CRC患者中也xian著升高。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。安徽，湖北，湖南，河南，河北，山东，陕西。

研究表明，m1A 是真核生物 tRNA 和 rRNA 丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明 m1A 修饰可调控 mRNA 翻译。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者，能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。我们承接上期的m5C RNA甲基化，为大家带来m1A RNA甲基化研究进展。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。m1A检测一站式服务，尽在云序生物。怀柔区m1A分析

Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰：Base-Resolution。云序生物m1AlncRNA测序

m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰，通过多种机制，比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异，m6A位点在转录本上的位置分布，以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响，近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序，分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。云序生物m1AlncRNA测序

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