案例3:拟南芥m5C RNA甲基化谱及TRM4B酶对根的影响 原文:Transcriptome-Wide Mapping of RNA 5-Methylcytosine in Arabidopsis mRNAs and Noncoding RNAs 期刊:The Plant Cell 影响因子:8.23 与上篇不同,本研究团队采用m5C RNA甲基化测序研究拟南芥中m5C甲基化谱,在种子,幼芽,根中发现了1000多个特异性的位点。敲低RNA m5C甲基转移酶TRM4B,造成tRNA稳定性的降低。研究人员还证实TRM4B突变体的初级根比野生型更短,同时对氧化的应激反应更敏感。在RIP-Seq中,富集峰表示全部活跃转录的区域(相对于对照IgG)。山西云序生物测序
外显子组测序利用序列富集技术特异性的检测基因组中的外显子区域(编码蛋白的DNA区域),能够直接发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变。与全基因组重测序相比,外显子组测序只针对外显子区域,性价比极高,更适用于大样本量疾病及ai症样本分析。外显子捕获试剂盒: 云序生物采用Agilent外显子捕获试剂盒,不仅能检测全部外显子区域,还能检测与蛋白功能密切相关的UTR区域 专业化的生物信息分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求海南测序lncRNA样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。
m6A环状RNA测序:近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A,即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰(N6-methyladenosine,m6A)。研究发现,m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰, m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。 目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术,云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务,技术原理如下: 将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序。
云序优势 单碱基分辨 m7G RNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。 抗体富集效率高 m7G MeRIP测序方式,采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。 高通量检测 可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。 全分子覆盖 可较全地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。 一站式服务 客户只需提供组织或细胞,云序生物一站式完成RNA抽提,样品预处理,建库,测序,数据分析全套流程。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求云序生物对m5C RNA-Seq实验每一步骤均设有关键质控,保证客户得到更佳数据。
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!云序采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。山西云序生物测序
云序生物利用启动子区(TSS-2000 ~ TSS+2000)富集峰对应的基因进行通路分析。山西云序生物测序
市场流通环境和强化消费信用体系建设,为加快建设覆盖线上线下的重要上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。体系,提供了重要保证。持续优化消费环境,促进商业繁荣,激发国内消费潜力,更好满足我们**消费需求,促进国民经济持续健康发展。通过线上数据的结合,打破固有视觉思维。所谓的传统是以成交为重点,而互联网思维是以用户体验为重点,这两件事情的视角不一样。对于用户而言,在与其可对接的选择里,更会优先信任价值提供方,这种客源基础奠定的销售更为稳固。互联网的重点是完成信息,信息让我们做决策,如果互联网的出现不能推动一个人基于数据做出对服务型的改变,某种意义上来说,这个产业就没有提供什么样的价值,因为随着5G场景的应用,这种感受将会提升。近年来,我国工业发展迅猛,但是,RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体并非顺风顺水。因为大量国外品牌入驻,占据着市场的消费力,给国内品牌造成了不小的竞争压力,但是国外品牌并非都是质量好的,很多价格昂贵品质又非常差,给企业用户造成了很大的损失。山西云序生物测序
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