为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异,RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织,发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化,而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现,AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大,且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目,暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,上海,北京,广州,天津、福建、广东,广西。河西区m1A结果
云序生物提供比色法检测整体m6A修饰水平、RNA修饰测序、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull-down机制等研究服务。2016年至今,检测样本数量累积超过5000+,MeRIP富集成功率高达98%以上。为解决客户样本量少的问题,云序早已经推出超微量MeRIP测序技术,500ng总RNA即可完成测序。特殊样本如血清,血浆,外泌体和石蜡等也可进行RNA修饰测序。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。河西区m1A结果RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域热门的方向之一。
案例1:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,原文:The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA,期刊:Nature 影响因子:41.456,芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文,该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行细致的分析,揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性,在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。
为了研究人细胞转录组中的m1A修饰,伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其guang泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段,发展了“m1A-ID-seq” 一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术,该研究成功实现了人细胞系全转录组水平的高分辨率m1A检测,鉴定出901个含有m1A修饰的转录本,并且发现m1A呈现强烈的5’非转录区分布特异性。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,云序技术优势,可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。
这家公司项目负责人不错,很细心也很耐心,之前陪我朋友去咨询过,云序生物的RNA甲基化项目的负责人真的很好,我朋友提出的疑虑都能认真的回答解说,我朋友也是经过多家对比之后还是觉得云序生物不错,选择跟云序生物合作,云序生物的口碑在RNA甲基化行业内还不错,你要先了解自己的需求,以及购买的预算然后再能选择,建议与他们的销售人员多沟通沟通,在这家做了m6a测序,实验做的很漂亮,很满意。后期如果还有实验要做应该还是会选他们家的。RNA甲基化位点motif分析。石家庄m1A测序
云序m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段。河西区m1A结果
2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。河西区m1A结果
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