上海RIP环状研究

2020年6月18日云序用户山大二院在Frontiers in Oncology (IF=4.85)上发表了一篇题目RNA-Seq Profiling of Serum Exosomal Circular RNAs Reveals Circ-PNN as a Potential Biomarker for Human Colorectal Cancer的文章，该文章通过运用了云序生物外泌体全转录组测序探究了环状RNA作为结肠ai分子标志物的可能性。 结肠ai（CRC）是第三大常见恶性tumour，早期CRC患者存活率远高于晚期患者，tumour的早期诊断对改善预后至关重要。近年来有许多研究发现，外泌体作为普遍存在于体液中的一种微囊泡，含有大量DNA、RNA和蛋白等分子，可以反应他们来源细胞的信息。许多ai细胞来源的外泌体内的分子具有成为cancer分子标志物的潜力。这其中，环状RNA由于其稳定性高，被作为多种cancer的分子标志物研究过。在这篇文章中，作者通过对50个患者和50和健康人血清中外泌体环状RNA的研究，提出了其中circ-PNN作为CRC诊断分子标志物的可能。云序优势：一站式服务，优化的实验流程，严格的质控，专业的生物信息学分析。上海RIP环状研究

云序专注于环状RNA研究，前期环状RNA筛选，云序提供全转录组及环状RNA测序相关服务；环状RNA验证，云序提供qPCR，RNaseR及Sanger测序等服务；文中环状RNA机制研究金钥匙——环状RNA Pull Down及RIP 环状RNA测序，云序均可提供全套服务！新年伊始，云序客户更是在环状RNA领域接连发表高分文章，包括世界首篇小鼠大脑创伤外泌体环状RNA文章；世界首篇非洲爪蟾环状RNA文章以及世界首篇红斑狼疮性肾炎环状RNA文章等等。云序致力于帮助客户在环状RNA研究领域占得先机，拔得头筹！重庆m1A环状DNA测序种类繁多，而且有些circRNA高于其相应的线性RNA10倍之多。

环状RNA作为新发现的RNA分子，从诞生之日起就是光环加身，屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇，较2018年增长约20%，其中大于10分的文章约60篇，是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万，环状RNA的火热程度可想而知。2020年国自然还未公布，但是小编预测环状RNA如果还是集中在吸附microRNA的ceRNA机制上，可能会造成**审美疲劳，影响中标率。环状RNA海绵机制并不是单一的环状RNA参与调控的机制。近期近期多篇关于环状RNA机制研究，揭示了环状RNA在tumour方向的研究进展。

从环状RNA结合功能蛋白角度，成功的向我们展示了核内circRNA具有重要生理功能，以及该类型circRNA的研究方法。首先通过高通量测序筛选与造血干细胞干性维持相关的circRNA分子，围绕该分子设计一系列体内、体外干扰实验，确定其可引起干细胞干性维持相关细胞表型改变。后续，与circRNA 海绵机制研究类似，RNA Pull Down实验及RIP实验成为机制研究成功与否的关键钥匙。作者基于RNA Pull-down技术筛选到可能与Cia-cGAS相互作用的蛋白质，并进一步通过RIP实验反向验证。环状RNA可通过RNA介导间接与蛋白质发生关联。

1.环状RNA测序，高通量筛选AZ处理相关环状RNA 各类农药(除草剂、杀虫剂和杀菌剂三类)对非洲爪蟾产生的包括神经发育、性腺发育等方面的伤害作用,使得非洲爪蟾作为农药污染监测的模式生物备受青睐。莠去津（Atrazine, AZ）是地下水和地表水中常见的环境内分泌干扰物之一。研究人员在Nieuwkoop-Faber（NF）第47阶段（孵化后第13天），将来自一对成年配偶的蝌蚪随机分为AZ处理和对照两组，随后收集雄性非洲爪蟾的睾丸组织（AZ处理组vs.对照组：3 vs.3）用于检测非洲爪蟾中所有环状RNA的表达情况，检测一共发现了68575条环状RNA。接下来，研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况，发现405条环状RNA差异表达（包括44条上调和361条下调），这暗示着这些环状RNA可能在AZ污染过程中发挥作用。目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。重庆m1A环状DNA测序

circRNA分子呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响。上海RIP环状研究

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