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该研究还表明,位于 5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的 m1A 可促进 mRNA 翻译,而位于编码区的 m1A 可抑制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的 m1A 甲基化修饰,还为进一步 m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,上海云序生物,一家专业做测序,试剂盒的良心企业。上海云序生物m1AlncRNA测序

上海云序生物m1AlncRNA测序,m1A

样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞: > 1×108,组织: > 5 g ,总RNA:> 300 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10 mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。东城区m1A研究作者将筛选的HIV病毒逆转录酶应用于m1A-seq中,并分别在rRNA和tRNA中检测了m1A的突变特征。

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2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。

1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性,采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化,对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果,捕捉碱基突变的信号,来实现m1A RNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定,为了增加检测灵敏度,作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段,作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中,已知tRNA第9,14和58位会发生m1A RNA修饰,通过这个技术,细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1A RNA修饰,以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1A RNA修饰位点。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化。

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m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。RNA甲基化富集峰可视化图。衡水分析m1A

m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。上海云序生物m1AlncRNA测序

目前热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RNA甲基化﹑m1A RNA甲基化。而m1A RNA甲基化是一个新进入大家的视野的RNA甲基化修饰类型,即 RNA 分子腺嘌呤第 1 位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。我们为大家带来m1A RNA甲基化研究进展。1. Nature:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,2.Cell:ALKBH1介导的tRNA去甲基化调控翻译,3. Nature Chemical Biology:全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰,4.Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰: Base-Resolution。上海云序生物m1AlncRNA测序

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