案例3:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊:Molecular Cell 影响因子:13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译,而位于编码区的m1A 可抑 制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰,还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。河北区分析m1A
研究表明,m1A 是真核生物 tRNA 和 rRNA 丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明 m1A 修饰可调控 mRNA 翻译。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。我们承接上期的m5C RNA甲基化,为大家带来m1A RNA甲基化研究进展。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。山西m1A分析云序m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段。
目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。该研究通过单碱基分辨率方法“m1A RNA甲基化测序”鉴定了细胞核和线粒体中 m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数 m1A 甲基化修饰富集在 mRNA的 5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的 m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的 m1A 甲基化修饰。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。
何川教授助力m1A甲基化修饰研究。2019年9月23日,美国芝加哥大学Bryan C. Dickinson团队与何川团队在Nature Methods上发表“Evolution of a reverse transcriptase to map N1-methyladenosine in humanmessenger RNA”研究成果,该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台,可快速选择逆转录酶,使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点,并使其发生突变,从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测,在测序过程中产生突变标记,终实现单碱基识别m1A,为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。作者将筛选的HIV病毒逆转录酶应用于m1A-seq中,并分别在rRNA和tRNA中检测了m1A的突变特征。
m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A。张家口分析m1A
m1A-MAP揭示核编码和线粒体编码转录本上不同类型的m1A甲基化组。河北区分析m1A
m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。河北区分析m1A
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