青海m7G环状RNA修饰

河南农业大学的研究团队利用云序生物提供的环状RNA测序服务，在小麦幼苗叶片中鉴定出大约88个环状RNA分子，而在脱水胁迫幼苗中有62个环状RNA分子存在差异表达。在脱水反应的环状RNA分子中，有6个在小麦中作为26个相应的miRNA的海绵。利用qPCR验证16个环状RNA，包括6个miRNA海绵和10个随机选择的环状RNA, 其中14个环状RNA与测序结果趋势一致，反应测序数据的真实性可靠性。GO分析和KEGG分析揭示circRNAs潜在的生物学功能，例如所涉及的参与脱水反应过程，如光合作用，叶绿素代谢，氧化磷酸化，氨基酸生物合成、代谢以及植物激su信号转导和生长素生物合成等。并且揭示了环状RNA与小麦叶片脱水抗性相关功能基因表达之间关系。circRNA分子呈封闭环状结构，不易被核酸外切酶RNaseR降解，比线性RNA更稳定。青海m7G环状RNA修饰

1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速轰动了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项youxiu青年基金，两项重点项目，94项面上项目，62项青年基金项目，15项地区科学基金项目。比如中医学和药理学方向，相信未来其他类型的tumour和学科方向必定会争取更多的环状RNA课题资助。与此同时，生命科学方向环状RNA研究显得略微低调些，河南m5c环状rna环状RNA（circRNA）是一类特殊的非编码RNA分子，也是RNA领域新的研究热点。

从环状RNA结合功能蛋白角度，成功的向我们展示了核内circRNA具有重要生理功能，以及该类型circRNA的研究方法。首先通过高通量测序筛选与造血干细胞干性维持相关的circRNA分子，围绕该分子设计一系列体内、体外干扰实验，确定其可引起干细胞干性维持相关细胞表型改变。后续，与circRNA 海绵机制研究类似，RNA Pull Down实验及RIP实验成为机制研究成功与否的关键钥匙。作者基于RNA Pull-down技术筛选到可能与Cia-cGAS相互作用的蛋白质，并进一步通过RIP实验反向验证。

（human papillomavirus）染上以及酗酒、吸烟等因素都有可能导致舌鳞状细胞cancer（tongue squamous cell carcinoma, TSCC）的发生，恶性舌cancer的增长会严重影响到病人的吞咽、呼吸、语言等正常生理功能，严重影响病人的生活质量。南通大学吴昊团队应用全转录组测序技术对TSCC病人的舌ai组织进行环状RNA研究，这一工作为舌ai发病机制和医治研究提供更多理论依据和研究基础，对332个差异表达环状RNA富集分析结果表明，这些环状分子可能参与cancer相关信号通路的调控。circRNA亦可直接通过局部碱基配对靶向mRNA。

2.环状RNA定量PCR及RNase R耐受实验，验证环状RNA的表达和结构 为了验证测序结果的准确性，研究人员随机选取了8条差异表达的环状RNA，利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测和RNase R耐受性实验。所有环状RNA的表达都能够被定量PCR实验检测到，并且定量PCR结果与测序结果趋势一致，表明环状RNA测序结果准确性非常高。所有环状RNA都能抵抗RNase R的消化，进一步证实了这些RNA的环形结构。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司，自行建立的环状RNA数据库circDB，借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。环状RNA哪家做得好，还是上海松江区的云序生物比较好。新疆环状结果

目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。青海m7G环状RNA修饰

研究指出，环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能，研究人员对它们的来源基因进行GO(Gene Ontology)分析。结果显示在脱水作用下，差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能，它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后，研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测，分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关，暗示着这6种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。青海m7G环状RNA修饰

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