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环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为cancer新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热仍在持续。环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。CircRNA由称为“反向剪接”的非经典剪接事件产生。吉林m6a环状

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环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20篇以上,“云序制造”越来越多的出现在科研论文当中。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的公司,拥有先进的技术,专业的团队,精密的仪器。天津m7G环状研究circRNA形成没有3’末端和5’末端的共价环状结构。

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“一站到底”!云序生物环状RNA研究从做谱(环状RNA测序、全转录组测序、环状RNA甲基化测序)到机制研究(RNA Pull Down、RIP),为您更全的覆盖差异环状RNA分子筛选到下游分子机制验证的重要研究环节。此外,云序生物自行建立并维护的环状RNA数据库circDB凭借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点,支持许多客户发表环状RNA成果。在过去的时间里云序生物和各位生命科学领域的**学者、医护工作者共同进步成长,探索未知的奥秘。回首过去,从表观遗传学到表观转录组学,从基因组到蛋白质组,从细胞内到外泌体,云序生物依托于高通量测序技术为越来越多的临床与基础生物研究者提供了高质量的科研服务。在我们的共同努力下,相信在新的一年里云序客户会发表更多的高分文章。

研究思路: 本文首先基于高通量手段比较了小鼠中LT-HSC,ST-HSC和MPPs中全转录组变化,共发现156种明显性差异表达的circRNAs。表达量验证证实9个circRNA在LT-HSC中明显性上调。在细胞表型层面,发现只有干扰D430042O09Rik转录的circRNA——Cia-cGAS后,可明显改变造血干细胞的亚群分布,作者因此锚定Cia-cGAS进行机制分析。作者通过Cas-9基因敲除策略成功构建了Cia-cGAS基因敲除小鼠,在Cia-cGAS基因敲除小鼠中LT-HSC明显性减少,I型IFN表达升高。通过RNA Pull-down实验,作者发现Cia-cGAS可以与cGAS结合,cGAS-RIP实验反向证实二者之间具有直接的相互作用。后续,作者通过生信预测结合EMSA实验分析了Cia-cGAS与cGAS相互作用的位点信息。酶学研究证明,Cia-cGAS可通过结合cGAS并抑制其活性。circRNA主要由外显子构成,少部分由内含子环化形成。

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鸡白血病病毒亚群(ALV-J)是一类逆转录病毒,该病毒会引起一种重要的感ran性疾病。患病的家禽会导致产蛋率的下降,大面积影响到家禽养殖产业。感ranALV-J的鸡免疫系统会受到严重的抑制并引起多种tumour疾病从而产生很高的死亡率,目前还不能通过接种疫苗的方式来防御这种疾病。来自华南农业大学广东省重点实验室的研究团队通过环状RNA测序的方式研究了病毒抗性与病毒易感的鸡肝脏组织当中环状RNA的表达,发现了32个差异表达的环状分子,其中12个在ALV-J抗性样本中表达量明显升高,而20个在易感样本中表达量更高,而生信预测表明这些环状RNA分子能够调控免疫分子通路的信息传递从而改变生物体的抵抗力。云序生物对ac4C RNA乙酰化检测手段为acRIP-Seq技术。四川m1A环状研究

circRNA的类型比想象的要复杂,可以来自基因组上多种基因结构。吉林m6a环状

中国医学科学院放射医学研究所刘强团队利用云序生物提供的全转录组测序服务成功揭示了circRNAs在小鼠空肠辐射后表达的变化,为研究circRNAs在辐射致肠损伤中的作用提供了靶分子。高质量的测序技术对每一个环状的表达都做到准确检测,生信分析可视化从宏观角度(染色体分布、成环位置)给出了所有对于放射处理后在小鼠空肠组织当中环状RNA分子的表达情况。筛选差异表达的环状RNA进行环状RNA定量PCR验证,GO分析揭示包括结合、催化、细胞因子和细胞分泌等GO条目均发生富集。KEGG分析预测结果显示差异环状RNA的靶基因与MAPK信号通路相关,理论与预测完全相符。海绵机制预测ceRNA网络图,按照海绵机制的反式调控方式,该网络中包括42个上调和48个下调的环状RNA分子,以及预测相互结合的22个靶基因mRNA。吉林m6a环状

上海云序生物科技有限公司拥有上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。等多项业务,主营业务涵盖RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。公司目前拥有专业的技术员工,为员工提供广阔的发展平台与成长空间,为客户提供高质的产品服务,深受员工与客户好评。公司业务范围主要包括:RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等。公司奉行顾客至上、质量为本的经营宗旨,深受客户好评。公司深耕RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,正积蓄着更大的能量,向更广阔的空间、更宽泛的领域拓展。

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