胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务。广东m6a环状RNA修饰
样本要求 样品类型: 组织、细胞、体液或总RNA样品。其它类型样品请咨询工作人员。 样品量: a)细胞:2×106 b)组织:50 mg c)体液:全血、血清、血浆 2-3 ml 脑脊液:5 ml 尿液:50 ml d)总RNA:2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5 无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 ) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝,不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。m5c环状RNA测序m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。
为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况,研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序,共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析,发现环状RNA可分为5类,其中基因间(intragenic)产生的环状RNA占大多数。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现62条环状RNA差异表达,这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性,研究人员挑选了16条环状RNA,利用“divergent primers”进行环状RNA定量PCR检测。
鸡白血病病毒亚群(ALV-J)是一类逆转录病毒,该病毒会引起一种重要的感ran性疾病。患病的家禽会导致产蛋率的下降,大面积影响到家禽养殖产业。感ranALV-J的鸡免疫系统会受到严重的抑制并引起多种tumour疾病从而产生很高的死亡率,目前还不能通过接种疫苗的方式来防御这种疾病。来自华南农业大学广东省重点实验室的研究团队通过环状RNA测序的方式研究了病毒抗性与病毒易感的鸡肝脏组织当中环状RNA的表达,发现了32个差异表达的环状分子,其中12个在ALV-J抗性样本中表达量明显升高,而20个在易感样本中表达量更高,而生信预测表明这些环状RNA分子能够调控免疫分子通路的信息传递从而改变生物体的抵抗力。环状RNA可直接与蛋白质结合。
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