吉林平台环状测序

云序环状RNA课题技术服务四大模块: 一、 环状RNA筛选： 1.1 circRNA测序 1.2全转录组测序（同时检测circRNA、lncRNA、mRNA） 二、环状RNA验证 2.1 qRT-PCR 对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务，包括引物设计与表达鉴定。 2.2 Sanger测序与RNase R酶耐受实验 对选定的环状RNA分子进行反式剪切位点引物设计，扩增后Sanger测序验证环状；使用RNase R酶处理环状RNA分子，验证环状RNA分子稳定性。 三、 CircRNA功能机制研究 3.1 RIP测序/qPCR 针对目标蛋白抗体把蛋白-RNA复合物沉淀下来，并对复合物上的RNA进行测序或对目标RNA进行qRCR表达分析。 与mRNA相比，m6A甲基化修饰在环状RNA上更普遍。吉林平台环状测序

自2013年的两篇在Nature期刊上对于环状机制研究成果问世以来，对于环状RNA的关注达到了空前的地步，迅速成为RNA领域火热的明星分子之一。环状RNA相比于线性结构的mRNA分子，具有更稳定的环状封闭结构，因此在循环体系中环状的表达量更稳定。多篇文章已报道环状RNA可行使“microRNA海绵机制”，通过竞争性的结合miRNA间接影响mRNA，在多种疾病的发生和发展中起到了重要的调控作用。环状RNA的研究从传统的“海绵机制”逐步发展多元化，更多的呈现出功能的多样性，如结合功能蛋白、编码蛋白潜能、影响可变剪切、受甲基化调控等。无处不在的功能覆盖让环状研究备受亲睐。新年伊始，云序生物公众号将为大家优中评优，悉数云序客户部分的环状RNA研究成果江苏m6a环状dnacircRNA形成没有3’末端和5’末端的共价环状结构。

从环状RNA结合功能蛋白角度，成功的向我们展示了核内circRNA具有重要生理功能，以及该类型circRNA的研究方法。首先通过高通量测序筛选与造血干细胞干性维持相关的circRNA分子，围绕该分子设计一系列体内、体外干扰实验，确定其可引起干细胞干性维持相关细胞表型改变。后续，与circRNA 海绵机制研究类似，RNA Pull Down实验及RIP实验成为机制研究成功与否的关键钥匙。作者基于RNA Pull-down技术筛选到可能与Cia-cGAS相互作用的蛋白质，并进一步通过RIP实验反向验证。

斑马鱼作为一种重要的模式生物，对于其环状RNA的研究还尚未报道。作者以雌雄斑马鱼混合组织为样品，通过云序生物提供的环状RNA测序和生物信息学服务发表了全世界首篇斑马鱼环状RNA表达谱文章。本研究共筛选到3868条环状RNA，为后续研究鱼类环状RNA的生物学功能奠定基础。环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品，严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章，受到了广大客户的一致好评。可以翻译成蛋白质，但大部分是非编码RNA。

作为明星分子，环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度？从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑：上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究，整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上，云序客户此前更是先后发表了全世界first斑马鱼环状RNA、first篇小麦环状RNA和first篇鸡环状RNA文章，如今首篇非洲爪蟾的环状RNA文章新鲜出炉了！这一成果今年年初发表在《Chemosphere》（影响因子4.2）上！环状RNA可直接与蛋白质结合。江苏m6a环状dna

circRNA可作为RBP海绵，即MBL与cirMbl的直接相互作用。吉林平台环状测序

1.环状RNA测序，高通量筛选AZ处理相关环状RNA 各类农药(除草剂、杀虫剂和杀菌剂三类)对非洲爪蟾产生的包括神经发育、性腺发育等方面的伤害作用,使得非洲爪蟾作为农药污染监测的模式生物备受青睐。莠去津（Atrazine, AZ）是地下水和地表水中常见的环境内分泌干扰物之一。研究人员在Nieuwkoop-Faber（NF）第47阶段（孵化后第13天），将来自一对成年配偶的蝌蚪随机分为AZ处理和对照两组，随后收集雄性非洲爪蟾的睾丸组织（AZ处理组vs.对照组：3 vs.3）用于检测非洲爪蟾中所有环状RNA的表达情况，检测一共发现了68575条环状RNA。接下来，研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况，发现405条环状RNA差异表达（包括44条上调和361条下调），这暗示着这些环状RNA可能在AZ污染过程中发挥作用。吉林平台环状测序

上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立，坐落于上海漕河泾新兴技术开发区，专注于表观修饰以及转录组领域，依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术，集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司，是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。云序生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队，以高度的专注和执着为客户提供RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体。云序生物继续坚定不移地走高质量发展道路，既要实现基本面稳定增长，又要聚焦关键领域，实现转型再突破。云序生物始终关注自身，在风云变化的时代，对自身的建设毫不懈怠，高度的专注与执着使云序生物在行业的从容而自信。