作为一种广fan存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA的研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种中环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。 云序生物客户发表的这项成果是全世界di一篇对非洲爪蟾环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何通过环状RNA高通量测序和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。种类繁多,而且有些circRNA高于其相应的线性RNA10倍之多。黑龙江平台环状测序
技术简介 环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生和发展密切相关。此外,环状RNA不易降解,能在血浆、唾液等体液中稳定存在,可以作为新型疾病分子标志物。当前,科研人员对这一功能性分子仍知之甚少,可见对其展开深入的研究是非常有必要的,一场科研的竞赛已悄然开始!云序生物提供的环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit,去除样本中的线性mRNA和rRNA,保留纯化后的环状RNA,因此测序获得的环状RNA有效数据量是其他测序服务供应商远远无法企及的,帮助客户以较低的成本检测到更多的环状RNA。此外,Cloudseq CircRNA Enrichment Kit覆盖几乎全部已知物种,对环状RNA的研究将不再局限于人、小鼠、大鼠等常见物种。江西外泌体环状研究m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。
作为一种普遍存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种的环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。云序生物客户发表的这项成果是全世界first篇对小麦环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何简单地通过环状RNA测序,环状RNA定量PCR和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。
研究指出,环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能,研究人员对它们的来源基因进行GO(Gene Ontology)分析。结果显示在脱水作用下,差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后,研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测,分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关,暗示着这7种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。云序生物作为业内成熟的测序公司,能为不同的客户提供个性化的服务。环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子。
1.环状RNA测序,高通量筛选AZ处理相关环状RNA 各类农药(除草剂、杀虫剂和杀菌剂三类)对非洲爪蟾产生的包括神经发育、性腺发育等方面的伤害作用,使得非洲爪蟾作为农药污染监测的模式生物备受青睐。莠去津(Atrazine, AZ)是地下水和地表水中常见的环境内分泌干扰物之一。研究人员在Nieuwkoop-Faber(NF)第47阶段(孵化后第13天),将来自一对成年配偶的蝌蚪随机分为AZ处理和对照两组,随后收集雄性非洲爪蟾的睾丸组织(AZ处理组vs.对照组:3 vs.3)用于检测非洲爪蟾中所有环状RNA的表达情况,检测一共发现了68575条环状RNA。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现405条环状RNA差异表达(包括44条上调和361条下调),这暗示着这些环状RNA可能在AZ污染过程中发挥作用。具有高度保守性,部分具有快速的进化性改变。陕西ac4c环状测序
circRNA可以与RNA结合蛋白相互结合影响亲本基因mRNA的表达。黑龙江平台环状测序
“一站到底”!云序生物环状RNA研究从做谱(环状RNA测序、全转录组测序、环状RNA甲基化测序)到机制研究(RNA Pull Down、RIP),为您更全的覆盖差异环状RNA分子筛选到下游分子机制验证的重要研究环节。此外,云序生物自行建立并维护的环状RNA数据库circDB凭借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点,支持许多客户发表环状RNA成果。在过去的时间里云序生物和各位生命科学领域的**学者、医护工作者共同进步成长,探索未知的奥秘。回首过去,从表观遗传学到表观转录组学,从基因组到蛋白质组,从细胞内到外泌体,云序生物依托于高通量测序技术为越来越多的临床与基础生物研究者提供了高质量的科研服务。在我们的共同努力下,相信在新的一年里云序客户会发表更多的高分文章。黑龙江平台环状测序
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