环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为cancer新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热仍在持续。环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA可直接与蛋白质结合。甘肃m6a环状平台
一、环状RNA表达谱: 作者将50个CRC患者和50个正常人的血清样品分别随机分为5组均匀混样,对混样后的5v5个样 品进行了外泌体全转录组测序, 检测到1924个环状RNA, 来源基因在各染色体上均有分布,环状大部分长度小于500nt。 二、CRC患者和健康人中环状RNA的差异表达 接着作者筛选出了122个在CRC与健康人血清外泌体中差异表达的环状RNA,其中100个明显上调,22个明显下调。其中65个为新发现的环状RNA。 三、差异环状RNA的功能预测 通过对环状RNA来源基因的GO分析预测差异环状RNA的功能,结果显示上调的环状的潜在功能富集在蛋白修饰和细胞对内源性刺激的反应相关功能, 高尔基体相关功能。此外KEGG分析还找到了这些基因参与的4个相关通路。甘肃m7G环状研究环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子。
作为一种广fan存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA的研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种中环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。 云序生物客户发表的这项成果是全世界di一篇对非洲爪蟾环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何通过环状RNA高通量测序和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。
环状RNA是一种新型的非编码RNA分子,是继miRNA和长链非编码RNA之后,近两年来热门的明星分子。随着测序技术与生物信息学分析手段的高速发展,研究者们对这种明星分子有了空前的认识。环状RNA以其独特的反式剪接方式形成,普遍存在于多种生物体内,并在cancer、心血管疾病和神经退行性疾病等多种人类重大疾病发挥重要的调控作用。利用高通量测序手段,研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达,证明了环状RNA在不同物种中普遍存在。circRNA与白血病、恶性胶质liu、胃ai、肝ai等疾病的发生、发展密切关联。
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!circRNA亦可直接通过局部碱基配对靶向mRNA。中国台湾环状
circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响。甘肃m6a环状平台
样本要求 样品类型: 组织、细胞、体液或总RNA样品。其它类型样品请咨询工作人员。 样品量: a)细胞:2×106 b)组织:50 mg c)体液:全血、血清、血浆 2-3 ml 脑脊液:5 ml 尿液:50 ml d)总RNA:2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5 无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 ) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝,不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。甘肃m6a环状平台
上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司,是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。公司自创立以来,投身于RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,是商务服务的主力军。云序生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念,影响并带动团队取得成功。云序生物始终关注商务服务市场,以敏锐的市场洞察力,实现与客户的成长共赢。