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为了研究人细胞转录组中的m1A修饰,伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其guang泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段,发展了“m1A-ID-seq” 一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术,该研究成功实现了人细胞系全转录组水平的高分辨率m1A检测,鉴定出901个含有m1A修饰的转录本,并且发现m1A呈现强烈的5’非转录区分布特异性。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A。内蒙古上海云序生物m1A

公司作为国内表观修饰&转录组领域的领jun者,拥有一支具有国际水准的生物信息分析团队,不仅可以提供标准化的生物信息分析,还可以根据课题需求,提供个性化的深度数据挖掘,与众多学术机构建立了合作关系。合作单位包括超过200家科研院所和高校、150余家医院等,与中国科学院,北京大学,复旦大学,上海交通大学,同济大学,浙江大学,山东大学,华南农业大学,华中农业大学等高校和研究院所建立了良好的合作关系,获得业内高度认可。未来,公司将致力于高通量技术在疾病预测、诊断、个性化医疗等方面的应用和开发,致力于为国内外科研和医疗用户提供国际先进的高通量检测系统解决方案。红桥区m1A全转录组测序m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。

近日,云序客户分别在肝ai和胃ai中进行了m6A和m5C RNA甲基化的全转录组测序(circRNA、lncRNA和mRNA),其中在肝ai中进行的m5C测序数据发表了三篇表达谱的文章,实现了一次测序,三套数据,三项成果的“大满贯”;随之在胃ai中进行的m6A测序数据也发表两篇表达谱文章。真正体现了一次测序三套数据(circRNA、lncRNA和mRNA),多项成果,超高性价比,短平快发表高分文章。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。

2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。

何川教授助力m1A甲基化修饰研究。2019年9月23日,美国芝加哥大学Bryan C. Dickinson团队与何川团队在Nature Methods上发表“Evolution of a reverse transcriptase to map N1-methyladenosine in humanmessenger RNA”研究成果,该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台,可快速选择逆转录酶,使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点,并使其发生突变,从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测,在测序过程中产生突变标记,终实现单碱基识别m1A,为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。作者将筛选的HIV病毒逆转录酶应用于m1A-seq中,并分别在rRNA和tRNA中检测了m1A的突变特征。河北m1A测序

云序m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段。内蒙古上海云序生物m1A

云序生物国内du家提供RNA修饰测序一站式服务。云序生物提供比色法检测整体m6A修饰水平、RNA修饰测序、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull-down机制等研究服务。2016年至今,检测样本数量累积超过5000+,MeRIP富集成功率高达98%以上。为解决客户样本量少的问题,云序早已经推出超微量MeRIP测序技术,500ng总RNA即可完成测序。特殊样本如血清,血浆,外泌体和石蜡等也可进行RNA修饰测序。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。内蒙古上海云序生物m1A

上海云序生物科技有限公司致力于商务服务,以科技创新实现***管理的追求。云序生物作为上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的企业之一,为客户提供良好的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物致力于把技术上的创新展现成对用户产品上的贴心,为用户带来良好体验。云序生物始终关注商务服务市场,以敏锐的市场洞察力,实现与客户的成长共赢。

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