m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序生物作为国内较早做m1A的科研平台,至今用户已发表10+篇m1A相关文章,其中多篇影响因子超过10分,成为国内m1A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广,包括编码mRNA和非编码lncRNA,circRNA,microRNA等分子。云序生物课堂,我们的公众号,欢迎咨询。南开区云序m1A
m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。大兴区上海云序生物m1A分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其存在于各种细胞系中。
RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA甲基化的研究已进行的如火如荼,但除了m6A以外仍有多种热门RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰,在这些领域的研究极具潜力,近期不断有高影响因子文章的出现(如表1)。云序生物是国内RNA修饰测序的先驱,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前,云序已累计支持客户发表25篇高水平文章,合计影响因子171.6分,是国内支持发文较多、累计影响因子较高的公司。
样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞: > 1×108,组织: > 5 g ,总RNA:> 300 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10 mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。上海云序生物,一家专业做测序,试剂盒的良心企业。
云序生物技术优势:可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。特异性高:m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体,可特异性富集m1A修饰片段。一站式服务:客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。专业的生物信息学分析:云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求。芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文,该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行较全的分析,揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性,在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。生物化学表征分析显示:ALKBH1在体外或者细胞内对tRNA中的m1A甲基化都具有去甲基化活性。承德研究m1A
近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。南开区云序m1A
目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。该研究通过单碱基分辨率方法“m1A RNA甲基化测序”鉴定了细胞核和线粒体中 m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数 m1A 甲基化修饰富集在 mRNA的 5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的 m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的 m1A 甲基化修饰。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。南开区云序m1A
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