甲基化m1A环状RNA测序

样本要求:样品类型：组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量：细胞： > 1×108,组织： > 5 g ,总RNA：> 300 μg (OD260/280≥1.8；OD260/230≥1.5；无明显降解，电泳检测样品特征性条带完整清晰，无明显弥散或拖尾 28S：18S≥1.5或者RIN≥7）,样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成5-10 mg的小块），可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后，-80℃保存，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，样品保存期间避免反复冻融。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化。甲基化m1A环状RNA测序

案例3：细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊：Molecular Cell 影响因子：13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外，线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明，位于5’UTR 区，尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译，而位于编码区的m1A 可抑 制翻译作用。因此，m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰，还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。西青区m1AlncRNA测序全国各地均有销售在线，请在官网留言咨询。

此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的，该课题组利用m1A-seq & RNA-seq（本实验云序提供）技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析，发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平，定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。

为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异，RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织，发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化，而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现，AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大，且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目，暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，上海云序生物，一家专业做测序，试剂盒的良心企业。

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这一分布规律与m6A（真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰）截然不同，后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上，并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3，并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此，该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1A RNA修饰的谱图，也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，甲基化m1A环状RNA测序

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