斑马鱼作为一种重要的模式生物,对于其环状RNA的研究还尚未报道。作者以雌雄斑马鱼混合组织为样品,通过云序生物提供的环状RNA测序和生物信息学服务发表了全世界首篇斑马鱼环状RNA表达谱文章。本研究共筛选到3868条环状RNA,为后续研究鱼类环状RNA的生物学功能奠定基础。环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。m6A RNA-seq的富集效率是决定数据质量的关键。安徽外泌体环状RNA修饰
环状RNA是一种新型的非编码RNA分子,是继miRNA和长链非编码RNA之后,近两年来热门的明星分子。随着测序技术与生物信息学分析手段的高速发展,研究者们对这种明星分子有了空前的认识。环状RNA以其独特的反式剪接方式形成,普遍存在于多种生物体内,并在cancer、心血管疾病和神经退行性疾病等多种人类重大疾病发挥重要的调控作用。利用高通量测序手段,研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达,证明了环状RNA在不同物种中普遍存在。广东m5c环状RNA研究环状RNA可通过RNA介导间接与蛋白质发生关联。
研究一:环状RNA分子筛选及验证 为探索造血干细胞功能相关的circRNA分子,作者比较了小鼠不同造血干细胞(LT-HSC,ST-HSC和MPPs)中全转录组变化情况,找出了156种明显性差异表达的circRNA分子,其中49种在LT-HSC中高表达。RNase R及qPCR实验证实其中9种为真实LT-HSC中高表达环状RNA 分子。为有效筛选造血干细胞相关的circRNA分子,作者通过体内circRNA干扰实验,发现只有干扰Cia-cGAS后才能明显影响小鼠体内造血干细胞亚群分布,并表现为LSK祖细胞数量明显增加,与此同时LT-HSC细胞数量明显减少。因此,作者结合转录组数据以及体内、体外验证实验,锚定Cia-cGAS分子进行后续分子机制研究。
环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热程度可想而知。2020年国自然还未公布,但是小编预测环状RNA如果还是集中在吸附microRNA的ceRNA机制上,可能会造成**审美疲劳,影响中标率。环状RNA海绵机制并不是单一的环状RNA参与调控的机制。近期近期多篇关于环状RNA机制研究,揭示了环状RNA在tumour方向的研究进展。2006年在果蝇中发现来自于Muscleblind的未知环状转录本。
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20篇以上,“云序制造”越来越多的出现在科研论文当中。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的公司,拥有先进的技术,专业的团队,精密的仪器。可以翻译成蛋白质,但大部分是非编码RNA。重庆RIP环状DNA测序
m5C环状RNA测序,是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。安徽外泌体环状RNA修饰
胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。安徽外泌体环状RNA修饰
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