环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期发表的《2019研究前沿》中,“环状RNA作为cancer新的生物标志物”成为生物科学领域6个新兴前沿之一。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热仍在持续。环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域新的研究热点。贵州外泌体环状RNA实时定量PCR
胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。贵州ac4c环状RNA研究环状RNA不同物质间进化上具有保守性。
3.2 RNA pull-down+MS/WB/qPCR/RNA-Seq 设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来,蛋白质谱检测或WB检测与RNA结合的蛋白。设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来,qPCR检测或RNA-seq检测与RNA结合的RNA。 3.3 双荧光素酶报告实验 双荧光素酶报告实验检测两个基因之间的互作。 3.4 病毒液以及siRNA设计 提供circRNA过表达以及干扰慢病毒,腺病毒以及设计siRNA。 四、CircRNA修饰研究 4.1m6A/m5C/ac4C/m7G/m1A等修饰 针对环状RNA各类修饰进行高通量筛选。 4.2 MeRIP-circRNA-PCR验证 对高通量测序的结果,通过qPCR进行进一步验证。
环状RNA作为新发现的RNA分子,从诞生之日起就是光环加身,屡屡登上Science、Nature、Cell等高分期刊。2019年环状RNA共发表SCI论文885篇,较2018年增长约20%,其中大于10分的文章约60篇,是2018年的3倍左右。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万,环状RNA的火热程度可想而知。2020年国自然还未公布,但是小编预测环状RNA如果还是集中在吸附microRNA的ceRNA机制上,可能会造成**审美疲劳,影响中标率。环状RNA海绵机制并不是单一的环状RNA参与调控的机制。近期近期多篇关于环状RNA机制研究,揭示了环状RNA在tumour方向的研究进展。环状 RNA 可以起到 microRNA 海绵的作用。
云序生物—环状RNA研究优势 云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。云序积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病。云序生物提供系统性环状RNA服务,从筛选(circRNA测序)到验证(qPCR)再到机制研究(RIP、RNA pull-down、ChIP、双荧光素酶实验)以及上游表观调控(m6A甲基化等各类RNA修饰研究),为您更全的覆盖环状RNA上下游分子机制验证的重要研究环节。除了提供组织和细胞的样本类型测序之外,我们还提供体液、血清血浆、外泌体石蜡样本等特殊样本的测序服务。回首过去,从国内发出circRNA测序到全转录组测序概念提出,到m6A等RNA甲基化测序平台出现,再到如今的eccDNA测序服务,我们一直在紧跟国际科研热点方向进行测序技术的创新。不同物种中鉴定的cirRNA数目是不一样的。山东环状文章
云序生物环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit。贵州外泌体环状RNA实时定量PCR
从环状RNA结合功能蛋白角度,成功的向我们展示了核内circRNA具有重要生理功能,以及该类型circRNA的研究方法。首先通过高通量测序筛选与造血干细胞干性维持相关的circRNA分子,围绕该分子设计一系列体内、体外干扰实验,确定其可引起干细胞干性维持相关细胞表型改变。后续,与circRNA 海绵机制研究类似,RNA Pull Down实验及RIP实验成为机制研究成功与否的关键钥匙。作者基于RNA Pull-down技术筛选到可能与Cia-cGAS相互作用的蛋白质,并进一步通过RIP实验反向验证。贵州外泌体环状RNA实时定量PCR
上海云序生物科技有限公司发展规模团队不断壮大,现有一支专业技术团队,各种专业设备齐全。在云序生物近多年发展历史,公司旗下现有品牌高通量测序,测序合成,科研,技术服务等。我公司拥有强大的技术实力,多年来一直专注于上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的发展和创新,打造高指标产品和服务。诚实、守信是对企业的经营要求,也是我们做人的基本准则。公司致力于打造***的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。