研究指出,环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能,研究人员对它们的来源基因进行GO(Gene Ontology)分析。结果显示在脱水作用下,差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后,研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测,分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关,暗示着这6种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。目前发现的circRNA主要来源于基因外显子。中国香港环状RNA甲基化测序
鸡白血病病毒亚群(ALV-J)是一类逆转录病毒,该病毒会引起一种重要的感ran性疾病。患病的家禽会导致产蛋率的下降,大面积影响到家禽养殖产业。感ranALV-J的鸡免疫系统会受到严重的抑制并引起多种tumour疾病从而产生很高的死亡率,目前还不能通过接种疫苗的方式来防御这种疾病。来自华南农业大学广东省重点实验室的研究团队通过环状RNA测序的方式研究了病毒抗性与病毒易感的鸡肝脏组织当中环状RNA的表达,发现了32个差异表达的环状分子,其中12个在ALV-J抗性样本中表达量明显升高,而20个在易感样本中表达量更高,而生信预测表明这些环状RNA分子能够调控免疫分子通路的信息传递从而改变生物体的抵抗力。四川m7G环状RNA测序circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响。
云序优势 适用于任何物种: 可以检测几乎任何动植物的环状RNA。 适用于降解样品: 可以检测部分降解的样品的环状RNA。 有效数据量高: 通过商业化kit富集环状RNA,极大地提高了有效数据比例。 性价比高:能够以较低的成本检测更多的环状RNA。 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。 专业化的生物信息学分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求。
人、大鼠、小鼠来源的环状研究已经取得了一定进展,农学背景的云序客户也在自己擅长的生物标本中进行了环状RNA研究,证明了环状在多个物种当中都起到了重要的生物学作用。河南农业大学研究团队出环状分子可以调控小麦在环境压力下对光合作用、卟啉、叶绿素代谢、氧化磷酸化以及氨基酸的生物合成等方面起到应答性的调控作用,天津医科大研究团队在快速心房起搏(rapid atrial pacing,RAP)犬模型的心房组织中探寻circRNA-miRNA网络,预测环状分子在离子通道活性和细胞骨架结构成分中起重要作用。莠去津(Atrazine, AZ)是一种环境内分泌干扰物,可以影响两栖动物发育过程。山东职业卫生研究中心研究团队通过比较AZ诱导发育异常组织和正常非洲爪蟾组织中环状分子的异常表达,推测环状分子可以参与wnt信号通路与孕酮介导的卵母细胞成熟信号通路。类似的,其他云序客户发表文章中还关注到了斑马鱼、鸡等其他物种当中环状RNA的重要生物学作用。越来越多的研究表明circRNA可发挥miRNA海绵或ceRNA的作用。
环状RNA作为一种新发现的非编码RNA,在多种组织及疾病中发挥重要的生物学功能,然而关于其在红斑狼疮性肾炎中的研究鲜有报道。红斑狼疮性肾炎作为一种免疫缺陷性疾病,严重影响了患者的身体健康和生活质量。云序携手中国医科大学周华主任团队在Cell子刊“Molecular Therapy Nucleic Acids”上发表重要研究成果,通过全转录组测序构建了该疾病的环状RNA表达谱,并从313条差异表达结果中挑选感兴趣的环状RNA--CircHLA-C。前期,作者发现miR-150在该疾病中发挥着重要的调控作用,通过生信预测结果显示该环状能够通过竞争性吸附miR-150。circRNA与白血病、恶性胶质liu、胃ai、肝ai等疾病的发生、发展密切关联。湖北环状RNA实时定量PCR
与mRNA相比,m6A甲基化修饰在环状RNA上更普遍。中国香港环状RNA甲基化测序
环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前、后及翻译水平严格调控细胞生殖生长等过程。云序曾对环状RNA经典研究思路进行过详细解析(2018国自然研究热点一环状RNA研究深度剖析),感兴趣的老师可以查询浏览。中国香港环状RNA甲基化测序
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