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肠道被大量的神经元所包围，以至于可以认为它本身就是一个神经系统。它如此的神秘与复杂，以至于被称为人类第二大脑。这些神经元通过密切监测各种分子线索来帮助日常行为，其中大部分被认为来自于我们的饮食或肠道微生物。但这些微生物并非在我们整个肠道中均匀分布。十二指肠的部分含有相对较少的微生物，而末端的结肠则聚集了绝大多数。通过分析小鼠肠道每肠段产生的蛋白质类型显示，神经元实际上是“各司其职”：根据所处的位置执行不同的功能。小鼠中固有的肠道相关神经元（iEAN）在功能上适应于它们所占据的肠段。但在无菌小鼠体内，这种梯度减小了：在这些小鼠中，微生物丰度较高区域的神经元数量与缺少微生物的十二指肠相似。这表明，微生物的丰度在很大程度上决定了神经元的区域差异。回肠和结肠神经元对微生物定植的反应比十二指肠神经元更敏感。自动粪菌分离仪菌群分离效果好就选上海沃本生物科技有限公司。云南全自动粪菌分离仪提取菌群含量高

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2011年，微生物学家Jeroen Raes提出了“肠型”的概念，根据肠道中的优势菌群来划分，传统分法为拟杆菌型（Bacteroides）、普氏菌型（Prevotella）和瘤胃球菌型（Ruminococcus）。在2017年，Raes对“肠型”进行了补充，将拟杆菌型分成了拟杆菌1型和拟杆菌2型。拟杆菌2型的特征包括微生物总体载量低，这种肠型的微生物组成在克罗恩病患者中比较常见。Raes的团队在《自然》杂志上，又一次发表了研究成果。他们指出，之前的研究发现并非巧合，拟杆菌2型的确可以被归类为“不健康肠型”，它与肥胖和系统性炎症水平高有关，在研究队列中，非肥胖人群只有3.9%为拟杆菌2型，而肥胖人群中这一比例上升到了17.73%。

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