生物菌肥根据其作用不同，又可分为5类：有固氮作用的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮蓝藻等；分解土壤有机物的菌肥：包括有机磷细菌和复合细菌等；分解土壤中难溶性矿物的菌肥：包括硅酸盐细菌、无机磷细菌等；促进作物对土壤养分利用的菌肥：包括菌根菌等；抗病及刺激作物生长的菌肥：包括抗生菌、增产菌等。果实品质明显提高：菌群中的侧孢芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌等可降低植物体内硝酸盐含量20%以上，能降低重金属含量，可使果实中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2~4度。乳酸菌、嗜酸乳杆菌、凝结芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等可提高果实中必需氨基酸(赖氨酸和蛋氨酸)、维生素B族和不饱和脂肪酸等的含量。果实口感好，耐储藏，卖价**解有机物质和***，防止重茬：菌群中的米曲菌、地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等有益微生物能加速有机物质的分解，为作物制造***养分、提供动力，能分解连作有毒有害物质，防止重茬。当前肥料品类繁多，从各种化肥、复合肥到各种有机肥、生物菌肥、多肽酶肥、有机无机肥等，五花八门。西安花椒生物菌肥阶格
有机肥与生物菌肥的区别①侧重点不同：有机肥是一种肥料，但生物菌肥的落脚点在菌上，更偏向其功能性，如提高肥力、促进土壤中难溶的矿质营养释放、增强植物抗病抗逆能力等。②使用方式不同：有机肥一般是作底肥、或生长期追肥；菌肥可用于拌种、基肥、追肥、蘸根等。③使用条件不同：有机肥一般无特殊的限制条件，但菌肥是“活”的，所以不可与杀虫剂、杀菌剂混用，也不能长期暴露于阳光照射下。此外，土壤的含水量、温度、pH条件等也会影响菌肥的效果。贵阳柑橘生物菌肥《农用微生物菌剂GB 20287-2006》是没有有机质、氮磷钾的要求。但是菌含量、杂菌率等质量要求。
选购生物菌肥时，要注意其是否过了产品保质期，一般超过生产日期1年的生物菌肥活性会显着降低。再看有无农业部登记证，正规的厂家生产的产品都有农业部登记的证明。还要看包装袋上标明的活菌数量是否符合国家规定（国家规定生物菌剂有效活菌数≥2亿/克，颗粒状的≥1亿/克，复合微生物肥料和生物有机肥有效活菌数≥2000万/克）。不合格的生物菌肥绝不购买。 生物菌肥可以单独使用，但比较好是与经过充分腐熟的有机肥混合使用，其效果要远好于单独施用有机肥或生物菌肥。生物菌肥不宜与化肥直接混合使用，高浓度的化学物质对生物菌肥里的微生物有毒害作用，尤其要注意不应将菌肥与含硫的化肥（如硫酸钾等）及草灰混合用，因为这样的肥料更容易杀死菌肥里的有益菌。
另一方面要增加有益微生物的种类和数量，也就是施用一定数量的菌肥。菌肥也称生物肥料、细菌肥料。确切地说，它们是菌而不是肥，主要成分不是营养元素，而是大量的微生物。它的功效在于通过微生物的活动，改善作物的营养条件并分解土壤中的有机质，使他们变成能够被植物吸收的营养，这就如同人吃的饭菜必须经过消化才能被吸收一样。秸秆还田后如果没有微生物的帮助，不仅不能被植物利用，还可能助长病菌的滋生；另一方面，再好、再多的菌肥撒在贫瘠的土壤中也不可能凭空转换出营养元素，有益微生物也会饿死。只有当有机物与有益微生物同时存在时，才能起到增肥防病的效果。一种按适当比例在大量有机物质中植入有益微生物的生物菌肥，其生物菌肥包括能够增加或转化营养的固氮菌、硝酸菌、溶磷菌、光合菌；能够分解有机质的酵母菌；能够分泌植物生长刺刺激药素和压制病菌的哈刺木霉、绿粘帚霉、放线菌以及一些芽胞杆菌和假单胞菌。生物菌肥种具有长效、快速见效、增产防病的优点，值得推广。它的优劣主要看植入的有益微生物种类和数量。在这里也提醒大家注意，生物菌肥和多效有机肥不宜长时间存放，要避免高温，一般也不能和杀菌剂混用“这是俺自制的生物菌肥,用了它之后。除了适合的土壤温度和湿度外，土壤中的有机质含量和氮含量也会影响菌肥效果。
促进快速生长：能产生刺激作物生长的生物***。菌肥中的微生物在土壤内的生命活动过程中，会产生大量的赤霉素和细胞***类等物质，这些物质在与植物根系接触后，能调节作物的新陈代谢，刺激作物的生长，从而使作物产生增产效果。
调节生命活动，增产增收：菌群中的胶冻样芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等有益菌可促进作物根系生长，须根增多。有益微生物菌群代谢产生的植物内源酶和植物生长调节剂经由根系进入植物体内，促进叶片光合作用，调节营养元素往果实流动，膨果增产效果明显。与施用化肥相比，在等价投入的情况下可增产15%~30%。
果实品质明显提高：菌群中的侧孢芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌等可降低植物体内硝酸盐含量20%以上，能降低重金属含量，可使果实中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2~4度。乳酸菌、嗜酸乳杆菌、凝结芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等可提高果实中必需氨基酸(赖氨酸和蛋氨酸)、维生素B族和不饱和脂肪酸等的含量。果实口感好，耐储藏，卖价高。
分解有机物质和***，防止重茬：菌群中的米曲菌、地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等有益微生物能加速有机物质的分解，为作物制造***养分、提供动力，能分解连作有毒有害物质，防止重茬。 首先，使用生物菌时，我们撒到地里的不叫菌肥，也不叫菌群，叫菌种。贵州口碑好生物菌肥介绍
据国家前环保部部长陈吉宁介绍，据保守估计，目前我国大约有1/5的农地被污染。西安花椒生物菌肥阶格
种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。避免光照直射。光照直射的情况下，一些菌都会杀死。西安花椒生物菌肥阶格
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