在细胞中,根据结构功能的不同,RNA主要分三类,即tRNA(转运RNA),rRNA(核糖体RNA),mRNA(信使RNA)。mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录;tRNA是mRNA上碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸的转运者;rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。细胞中还有许多种类和功能不一的小型RNA,像是组成剪接体的snRNA,负责rRNA成型的snoRNA,以及参与RNAi作用的miRNA与siRNA等,可调节基因表达。而其他如I、II型内含子、RNaseP、HDV、核糖体RNA等等都有催化生化反应过程的活性,即具有酶的活性,这类RNA被称为核酶。在病菌方面,很多病菌只以RNA作为其中的遗传信息载体(有别于细胞生物普遍用双链DNA作载体)。使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,**白迅速与核酸分离。天津RNA提取试剂
RNA提取:主要试剂Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,压制细胞释放出的核酸酶。1. Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。2. RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低较后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时较好在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。4. 酵母和一些细菌由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol试剂同时加入无RNase的玻璃珠并剧烈振荡,使细胞裂解充分。2-8℃ 避光保存一年。郑州正规RNA提取试剂哪里买rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。
酵母RNA的提取方法:浓盐法。酵母菌外层是厚达 1.2µm 的细胞壁,其化学成分 是葡聚糖(30-40%)和甘露聚糖(30%),此外,脂类8.5-13.5%,蛋白质 6-8%,还含有几丁质,酵母菌的葡聚糖,分子是为 240000 道尔顿,是一种分枝聚合物,葡聚糖与甘露糖之间由蛋白质维系起来。近 10% 的甘露聚糖的侧链通过磷酸二酯键与磷酸边接,所有这些连接方式都使得酵母提取物首要的也是关键的是如何破坏细胞壁。破壁方法有自溶破壁、酶法破壁等多种方法,而用高浓度盐溶液处理,同时加热,以改变细胞的通透性,就可以使核酸从细胞内释放出来。由于 RNA 钠盐易溶于水, 在含盐的菌体溶液中, RNA 有较高的溶解度, 这样, 通过控制温度使蛋白质变性沉淀,通过离心将 RNA 及蛋白质和脱核酵母菌体分离, 从而达到提取之目的。其中食盐起到自溶促进剂,以及防腐与脱臭的作用。
经典Trizol法并不能获得总RNA:这个事实可能会刷不少新手甚至老手的三观,但确有实验支持:经典Trizol法会选择性丢失低GC比的miRNA。这一点,源自一则作者自撤稿的故事。V. Narry Kim是韩国鼎鼎大名的美女科学家,专做RNA相关的研究,包括miRNA。几年前她们组发现一个奇怪的“现象”,即贴壁细胞在消化之后,会有一些miRNA的丰度突然降低,看起来好像是被快速“降解”掉了,并据此写了一篇文章发到Molecular Cell上。但很快她们就发现,这个“现象”难以重复:如果用Trizol做实验,就一定是阳性结果,而用试剂盒提RNA,就重复不出来。难道是号称能提总RNA的Trizol方案出了问题?确实如此。经进一步实验后发现,经典的Trizol方案会使得低GC比的miRNA丢失。RNA在260nm波长处有较大的吸收峰。
对RNA的科学研究,首先要从植物或者动物等组织中提取出合格的RNA。在实际RNA提取中,有几个提取原则:1、保证RNA一级结构的完整性;2、提取的RNA样品中不应存在对酶存在压制作用的有机溶剂及过高浓度的金属离子;3、其他生物大分子如蛋白质、多糖和脂类分子的污染应降低到较低程度;4、排除其它核酸分子(DNA)的污染。常用RNA提取方法有:1TRIzol法;2TRIzol+过柱法;3CTAB+过柱法;4试剂盒法。RNA提取试剂盒Biomarker Plant Total RNA Isolation Kit (Polysaccharides&Polyphenolics–rich),能从植物组织,特别是富含多糖多酚或淀粉的植物组织(如成熟水稻叶片,棉花叶片,拟南芥种子,香蕉,马铃薯块茎,苹果,西瓜果肉,猕猴桃,梨,月季等)中快速提取总RNA,同时可以处理大量不同样品。异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质。郑州正规RNA提取试剂哪里买
专门的高盐缓冲系统允许RNA物质基团结合到旋转柱的玻璃纤维基质上,同时使污染物通过柱被有效地洗去。天津RNA提取试剂
科学家曾经在实验室里就成功地让RNA实现了自我复制的功能。不仅如此,还有科学家构建了一种DNA-RNA杂交基因组的大肠杆菌。这个实验证明,即使有DNA-RNA的杂交链的中间态,生物也不至于会死亡。所以,RNA较早可能给就是生物的遗传物质,只是后来逐步被替代了。当然,还有一些次要的原因,比如,我们都知道DNA是在细胞核当中的,完成生命活动这些步骤其实都在细胞核外进行,因此这样其实更加安全。而如果是RNA,那就没有必要存在细胞核了,但是当细胞损失时,就很容易出现问题。因此,DNA后来逐渐取代了RNA作为生物的遗传物质。但这并不是说RNA不能够作为遗传物质,相反它是可以作为遗传物质而存在的。天津RNA提取试剂
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RNA提取关键点病菌RNA在提取后也仍然具有传染性,在提取时,实验人员需要佩戴口罩和手套等各种防护装备,以防实验室污染。而有种「自动灭活」的方法,在更加便利的同时,也能更好的保护实验人员的安全。许多样品中含有高水平的RNase,这种酶也会加速RNA的降解。为了使这种酶对降解的影响较小化,较好在采集时就稳定好样本中的RNA。这种情况下,可以在裂解缓冲液中立即进行溶解。比如可以通过TRIzol®、RNA裂解缓冲液等使RNase失活,然后再处理样本。另外,再采集样本之后马上加入DNA/RNAShield,可以快速降解掉RNase等蛋白物质。当然,DNA/RNAShield也会保证取样时微生物基因多样...