首先，微生物菌剂促生根的原理不同于生根剂生根粉促生根的原理。
生根剂生根粉促生根的原理：在作物生产应用中有吲哚乙酸、吲哚丁酸、萘乙酸，御根生，br生根剂，复硝酚钠等多个成分，是在植物体内维持植物的顶端优势，诱导同化产物向产品（果实）运输，促进植物生根等。
微生物菌剂促生根的原理：通过施入土壤后开始繁殖分泌出来的分泌物比如几丁质酶，生根素等物质改善土壤环境，间接作用于植物，并不是直接作用植物，基本适用于所有植物。 有益菌群相互协同，共同作用，能使作物达到高产丰产的效果。云南官方微生物菌剂
由于长期使用化学肥料，我国的土壤已经不再“健康”，土壤性状恶化、土地板结、土壤酸化、盐渍化、土壤微生物多样性被破坏等问题越来越突出，并直接导致了土壤贫瘠、地力衰竭等问题，影响了农业的可持续发展。在土壤生态如此恶劣的形势下，在改良土壤、提升地力、改善土壤生态环境、提高农作物产量和品质方面有着重要作用的微生物菌剂迎来发展机遇。
微生物菌剂正确定位属于特肥产品
农用微生物菌剂是指目标微生物（有效菌）经过工业化扩繁后加工制成的活菌制剂。它具有直接或间接改良土壤，恢复地力，维持根际微生物区系平衡，降解0、有害物质等作用，应用于农业生产，通过其中所含有的微生物的生命活力，增加根际养分的供应量或促进植物生长，改善农产品品质及农业生态环境。 香蕉微生物菌剂排名靠前科学研究发现，没有有机质，就没有肥沃的土壤。有机质对农作物是极其重要的，是农作物的重要营养来源。
1、微生物在土壤中物质、能量的输入输出中扮演着非常重要的角色，能够活化土壤有机与无机养分，分解有机物，释放养分，增加养分的有效性；
2、微生物通过代谢过程中氧气和二氧化碳的交换以及分泌的有机酸等酸性物质，促进土壤中微量元素的释放及螯合，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况，促进有机质、腐殖酸和腐殖质的生成；
3、微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、有机农药、重金属和其他污染物等，降低土壤污染的程度。
而微生物菌剂隶属于生物肥料这个大类，对土壤各种问题的解决具有奇效。微生物菌剂的使用**减少了化肥的用量及减少污染，而且通过微生物之间或与植物之间的互相作用，植物的抗病与抗逆能力**增强，这对于提高农作物品质及产量有着重要意义。
土壌微生物受到土壤理化性质、特别是土壤pH、土壤构造、土壤含水量、土壤有机物量等影响、土壤中的各种微生物会产生增殖消亡，**终达到并保持适合当地土壤的相对的稳定状态。在不改变土壤理化学性质的前提下，想改变土壤微生物结构非常难。因为外部投入的微生物想在竞争中战胜土著微生物非常困难。微生物菌剂无法形成植物生育所必需的营养成分，所以无法代替肥料。
经销商发展困难的主因在于农民不接受。没有说到农民痛点，效果差异很大，品种，特点太多，农民无所适从，厂家困惑“传递”到商家和农民。 这种菌剂用于拌种或蘸根，具有直接或间接改良土壤、恢复地力、预防土传病害。
市场鱼龙混杂，真假难辨，劣币驱逐良币的现象还是不少的，农户不会拿种植的东西开玩笑，需要好的人员来推广，很多不良厂家生产的伪劣产品损害了农户利益，农户不再相信，很多厂家重视生产，不重视推广，想推广找不到***推广人员，导致微生物菌剂在国内很难以推广，这都是为什么微生物菌剂或者说其他新产品很难铺展开的原因。
微生物菌剂是技术含量较高的精细化产品，它的使用相对而言更值得考究。
尤其是推广人员，更应该把握好微生物菌剂的应用技术。如果技术推广人员，简单的随水冲施，灌根之类的，他的试验示范很可能事倍功半，大部分这样做的企业试验示范开始时看到效果，但后期就没什么区别了，因为并未切实了解微生物菌剂的作用条件和使用条件，包括他们推广不同方向的使用方式都是有差别的。
工业化、现代化的发展进程中，经济快速发展，引起了一系列的环境问题。昆明微生物菌剂零售价格
土壤的组成是固相、液相、气相三类物质，主要包括矿物质、有机质、水分、空气和微生物。云南官方微生物菌剂
微生物菌剂是指目标微生物（有效菌）经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂（如草炭、蛭石），吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂。这种菌剂用于拌种或蘸根，具有直接或间接改良土壤、恢复地力、预防土传病害、维持根际微生物区系平衡和降解0害物质等作用。
农用微生物菌剂恰当使用可以提高农产品产量、改善农产品品质、减少化肥用量、降低成本、改良土壤、保护生态环境。
按剂型可分为：液体、粉剂、颗粒型；
按内含的微生物种类或功能特性可分为：根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等。
按照复合方式分为：微生物菌剂和复合微生物菌剂
农用微生物菌剂国家标准：（GB20287-2006）
复合菌剂：每一种有效菌的数量不得少于0.01亿/g（mL）；以单一的胶质芽胞杆菌制成的粉剂产品中有效活菌数不少于1.2亿/g。 云南官方微生物菌剂
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