首先，要选择正规厂家的产品。具备农业部微生物肥料登记证，包括：微生物菌剂登记证、生物有机肥登记证，或复合微生物肥料登记证；
其次，要核对执行标准。农用微生物菌剂执行的是国家标准，为GB20287-2006，生物有机肥和复合微生物肥执行的是行业标准，分别为NY884---2012和NY/T798-2015；
再次，要查看包装袋上菌数的标注。菌剂中的有效活菌数液体含量要≥2亿/克颗粒的要≥1亿/克，生物有机肥和复合微生物肥中的有效活菌数含量要≥2000万/克。
在满足以上3个条件的情况下，用户可以根据所需要的功能选择含有特定功能菌种的微生物菌肥。
菌肥的质量要看其所含“有效活菌”的数量，活菌越多效果约好，特别说明要是活菌！ 微生物肥料是以微生物的生命活动导致农作物得到特定的肥料效应而使作物生长茁壮或产量增加的一类制品。陕西专业生物菌肥
我们要知道生物菌肥（剂）类产品，按内含的微生物菌种类或功能特性可分为根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等不同类别。微生物菌肥（剂）类产品对应的执行对应的标准是《农用微生物菌剂GB20287-2006》，包括农用微生物菌(肥）剂和有机物料腐熟剂两大类产品。请各位仔细看一下内容：
此表为农用微生物菌剂（肥）类产品执行的技术指标
通过上表我们看到：
***、农用微生物菌（肥）剂的主要技术指标是：有效活菌数(cfu)，亿个/g或mL，液体型和粉剂型的农用微生物菌（肥）剂要求有效活菌数≥2.0亿个/g或mL而颗粒≥1.0亿个/g；其中复合菌剂，每一种有效菌的数量不得少于0.01亿个/g或mL；
第二、以单一的胶质芽胞杆菌（Bacillusmucilaginosus）制成的粉剂产品中有效活菌数不少于1.2亿/g。
第三、农用微生物菌（肥）剂有杂菌率的要求，液体≤10%，粉剂≤20%，颗粒≤30%。
第四、粉剂的含水量要求≤35%，颗粒的含水量≤20%。
第五、细度、PH值、保质期都有明确要求。 云南茶叶生物菌肥土壤功能退化，作物生长不良、病害加重、品质下降及产量降低甚至绝收等问题日益严重.
另外，相对于孢子来说，活菌的门槛是比较低的，它的生产工艺要求也没有那么高。因为孢子的休眠状态是在包装之前就发生了的，这一工艺在国内还存在着非常大的技术壁垒，目前并没有多少厂家能真正在包装之前使活菌进入休眠状态。
所以大部分生物菌的活菌在包装之前**多就是抽离水分的干燥处理而已，在包装过程中往往还有许多活菌处于活跃状态，它们在包装后的贮存期间必须进行自我休眠，但在这个过程中，活菌会死掉不少。这也是市面上活菌制剂的质量良莠不齐的主要原因之一。
而生物菌肥里的活菌往往在包装之后不能自动休眠，而始终处于活跃状态。一旦贮藏的时间过长，这些活菌基本上都死了，只剩下普通肥料的肥效。
生物肥对于果树主要有5大作用：
一、改变根量，由细菌产生的IAA、GA、CTK使植物次生根增殖，增加有效根量。
二、软化细胞壁，细菌产生的半聚糖醛酸转化酶（PATA）可软化根系细胞壁，从而促进营养吸收。
三、产生转铁产物，细菌产生的转铁产物可聚合或螯合土壤铁，使之成为对果树更有效的物质。
四、增加磷的有效性，细菌分泌出增加石灰性土壤中磷有效性的酸性物和螯合物。
五、阻止病害，细菌改变根际环境，从而***根系病原体的竞争力。 土壤中施入较多的菌肥，虽然不会出现烧根烧苗现象，但也并不是施得越多就越好。
这种新型肥料对农民来说是个盲区。正确看待区域代理商和生产厂家在乡村的夸大宣传，有的还拿着显微镜忽悠**，不讲自家的菌肥是什么菌，起什么作用，在什么条件下施用，怎样施用。果农要不断学习，弄清微生物菌肥不是***的***肥料。
每种有机菌肥有它的属性和作用。如球状芽孢杆菌是细菌杀虫菌、EM菌抗重荏菌，乳状芽孢杆菌是长效细菌杀虫菌。枯草芽孢杆菌是细菌，能有效防治根系周围的细菌，使作物免受侵害。地衣芽孢杆菌是细菌性防病菌，不要轻信菌能治黄叶、小叶等生理病害。能治黄叶、小叶的是有机肥而不是菌。 微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、有机农药、重金属和其他污染物等。陕西专业生物菌肥
目前，菌肥中所用的菌种一般属于中温性微生物，土壤温度在25-37℃时，**利于菌的生长和繁殖。陕西专业生物菌肥
与化肥混用要注意化肥用量不能过大。高浓度的化学物质对菌肥里的微生物0害作用，尤其注意不能与碳酸氢铵等碱性肥料和硝酸钠等生理碱性肥料混用。
***，注意千万不要与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫化肥，如***钾等以及稻草灰混合用，因为这些药、肥很容易杀死生物菌。在施用时，若施菌肥与防病虫、除草相矛盾时，可先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。同时还应防止与未腐熟的农家肥混用，因为农家肥在腐熟的过程中会发酵，这样会直接杀死生物菌。
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