复合模式（Mixed-Mode）填料整合疏水、离子交换、氢键等多种作用力，通过协同效应实现传统单模式填料无法达到的选择性。Capto MMC和Capto Adhere是典型，前者兼具弱阳离子交换和疏水作用，后者整合强阴离子交换、疏水及氢键作用。这类填料可在电导率较高条件下结合蛋白，简化样品前处理，对电荷异构体、聚集体和HCP残留去除效果明显。其优势在于工艺步骤缩减潜力大，可实现"两步法"替代传统"三步法"纯化策略，提升收率并降低成本。挑战在于方法开发复杂，需筛选pH、盐浓度和添加剂。在抗体、重组蛋白精纯中应用日益，是工艺强化（Process Intensification）的关键工具。
反相层析（RPC）填料以C4、C8或C18烷基键合硅胶为基质，通过疏水性差异分离蛋白，提供所有层析模式中比较高的分辨率。丁基硅胶（C4）适蛋白分离，孔径通常300Å以避免空间位阻。Sepax Proteomix和Waters XBridge是高性能，可耐受宽pH范围（2-10）。RPC的优势在于质级纯度制备，能分离差一个氨基酸的异构体，分析级柱效可达100,000理论塔板数。但有机溶剂（乙腈、异丙醇）易导致蛋白变性失活，且上样量低。主要应用于肽段、胰岛素等稳定小蛋白的精纯，以及抗体药物偶联物（ADC）的DAR值分析控制。在生物制药中多用于分析而非制备，是质量控制的关键技术。重组蛋白用分离介质价格膜色谱填料集成于囊式装置，适合一次性使用和灵活放大。
磁性蛋白纯化填料是近年来发展迅速的新型功能填料，其特点是在填料基质中引入磁性纳米颗粒（如Fe₃O₄），使填料具备响应外部磁场的特性。这类填料的分离流程无需传统的色谱柱和高压泵系统，只需通过磁场即可实现填料与样品溶液的快速分离，大幅简化了纯化操作步骤，缩短了纯化时间。磁性填料通常表面修饰有亲和配体（如His-tag特异性配体、抗体、抗原），可实现目标蛋白的特异性富集，具有操作简便、快速高效、样品损耗少的优势，尤其适合少量样品的快速纯化和高通量筛选实验。此外，磁性填料的机械强度高，可重复使用，且易于自动化操作，在科研实验室和临床诊断领域具有广阔的应用前景。
亲和标签对应的特异性填料是重组蛋白纯化的介质，其设计原理是基于重组蛋白所携带的亲和标签与填料表面配体的特异性结合。目前常用的亲和标签包括组氨酸标签（His-tag）、谷胱甘肽S-转移酶标签（GST-tag）、麦芽糖结合蛋白标签（MBP-tag）、Flag标签等，对应的特异性填料分别为金属螯合亲和填料、谷胱甘肽亲和填料、麦芽糖亲和填料、Flag抗体亲和填料等。这类填料的优势在于特异性极强，可直接从复杂的细胞裂解液中一步富集目标蛋白，纯化倍数可达数百倍，大幅简化了纯化流程，提高了纯化效率。同时，亲和标签可通过酶切去除，获得天然结构的目标蛋白，因此在重组蛋白的科研和生产中得到广泛应用。离子交换填料根据蛋白表面电荷差异，在特定pH下进行吸附分离。
配基在填料表面的密度（偶联量）是影响载量和选择性的重要因素。密度过低则载量不足；密度过高可能导致空间位阻，反而降低有效载量，或因多价结合而过强吸附，洗脱困难。配基与基质的偶联化学必须稳定，能耐受纯化、在位清洗和长期储存的条件。常用的活化方法包括溴化氰法、环氧法、NHS酯法等，它们与配基上的氨基、巯基或羟基反应形成共价键。先进的偶联技术能够实现配基的定向固定，以优化其空间取向和生物活性。现代蛋白纯化实践中，用户可以选择购买商品化的预装柱，或购买散装填料自行装填。预装柱由厂商使用精密设备装填，柱效高、重现性好、开箱即用，节省时间，特别适合方法开发、小规模制备和需要高重复性的QC分析。自装柱则更具灵活性，用户可根据需要选择不同规格的空柱和填料，成本效益更高，适合工艺摸索和特定规模的生产。选择何种形式取决于应用需求、预算以及对工艺控制的要求。填料粒径影响分辨率，小粒径提供高分辨率但操作压力较高。抗体偶联药物用层析介质厂家直销
填料的化学稳定性决定了其可耐受的清洗和消毒试剂。磁珠型分离填料源头厂家
预活化填料（如NHS-activated Sepharose、Epoxy-activated Agarose）提供活性官能团，允许用户自行偶联特定配基（抗体、酶、小分子），定制亲和介质。这类填料保存期长（2-8℃下>1年），偶联效率高（>90%），配基密度可控（1-20 μmol/mL）。优势在于灵活性极高，可针对罕见蛋白或特殊需求快速开发层析介质，避免商业填料长期开发周期。缺点是需优化偶联条件，且重复生产一致性需验证。适用于科研定制、临床前样品制备以及小规模诊断试剂生产。在COVID-19疫苗研发中，预活化填料被用于快速制备中和抗体亲和介质，展现了应急响应价值。磁珠型分离填料源头厂家
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