标记神经元：在动物体内，特定的荧光染料可以稳定且持久地标记皮质脊髓神经元，用于病理生理学研究和切片膜片钳研究。如将Fluoro-Red和Fluoro-Green注入麻醉新生大鼠的颈脊髓，固定的脑切片显示出离散的内部皮质层中细长或金字塔形细胞轮廓中的***荧光，与V层锥体细胞一致，并且标记的神经元使用切片膜片钳方法显示出自发突触活动4。用于细菌成像：有机荧光染料可用于大肠杆菌的超分辨率成像实验。通过分光光度计测定大肠杆菌的生长曲线，以及将大肠杆菌与有机荧光染料尼罗红共孵育，在超分辨率显微镜下实现了大肠杆菌细胞壁的荧光标记。这一实验既结合了生物化学和分析化学相关实验及仪器的原理和操作，也有利于学生深入了解新型的细菌荧光标记技术6。近红外荧光寿命成像：近红外（NIR）染料在小动物成像和漫射光学断层扫描中用作荧光标记。通过三种方式将现有的共聚焦和多光子激光扫描显微镜（LSM）与时间相关单光子计数（TCSPC）荧光寿命成像（FLIM）系统相适应，用于近红外FLIM。测试的许多近红外染料在生物组织中显示出明显的寿命变化，取决于它们所结合的组织结构，因此近红外FLIM可以提供有关组织组成和局部生化参数的补充信息7。噁嗪衍生物荧光染料由于其在动物神经成像方面的潜在应用价值，近年来受到了关注。广东流式细胞荧光染料
化学稳定性方面的差异芳香环融合BOPHYs：具有6,5,6,6,5,6-六环稠合环的新型红色α-苯并稠合BOPHY和具有5,5,6,6,5,5-六环稠合环的β-噻吩稠合BOPHY，与母体BOPHY相比，具有很高的化学稳定性1116。这些染料通过多种表征手段，如NMR光谱、HRMS、X射线结构分析、循环伏安法和光学测量等，证实了其化学稳定性。芳环稠合导致HOMO能级显著提高，有效扩展了π共轭，赋予了这些染料独特的结构和吸引人的光物理性质，同时也提高了其化学稳定性。对称双偶氮苯红色染料：两种新型对称双偶氮苯红色染料末端带有吸电子或给电子基团，具有良好的溶解性、优异的化学和热稳定性。在溶液和固态下均具有荧光性13。这表明特定的化学结构设计可以使荧光染料具有较高的化学稳定性。化合物荧光染料脂质动物成像技术不仅在医学研究中具有重要应用，还可以拓展到其他领域。
DiI染料标记机制DiI（1,1'-dioctadecyl-3,3,3',3'-tetramethylindocarbocyanineperchlorate）是一种亲脂性的荧光染料，常用于神经元标记。在大鼠中，通过结晶状的荧光DiI可以对牙初级传入神经元（DPANs）进行逆行荧光标记。在小鼠中，虽然也可以使用DiI进行标记，但之前*能使用Fluoro-Gold这种具有神经毒性的荧光染料，且其膜穿透特性优于碳菁染料。后来研究人员对DiI在大鼠中的标记技术进行了重新评估，旨在将其应用于小鼠。新型的DiI配方具有改进的穿透性能和染色效率，可以评估轴突染料从应用部位到三叉神经节的运输速度、染色的DPANs数量以及荧光强度。其标记机制主要是利用DiI的亲脂性，能够与神经元细胞膜结合，随着轴突的运输而扩散到神经元的各个部位，从而实现对神经元的标记。
肿瘤细胞成像：近红外荧光染料IR-780具备使多种肾透明细胞*细胞显像的能力，对正常肾胚上皮细胞则无此能力，可用于血液中肾透明细胞*细胞的特异性诊断。这为肿瘤细胞的检测和诊断提供了新的方法21。疾病标志物检测：设计合成的近红外荧光探针RB-Phenylacrylate(NOF1)，用于高选择性和高灵敏度检测半胱氨酸(Cys)，并成功应用于活细胞、斑马鱼和小鼠中半胱氨酸的近红外荧光成像检测。近红外荧光探针RB-Phenyldiphenylphosphinate(NOF2)用于过氧亚硝酸根的荧光成像，实现了活细胞和小鼠炎症模型中ONOO⁻的荧光成像检测。这些探针为疾病标志物的检测和成像提供了新的手段23。四、支持超分辨率成像新型近红外氧杂蒽荧光染料如KRhs，可用于超分辨率成像。KRhs显示出强烈的近红外发射峰，在700nm处具有高荧光量子产率，且在没有增强缓冲液的帮助下，表现出随机荧光开关特性，支持单荧光团的时间分辨定位。KRhs被功能化为KRh-MitoFix、KRh-Mem和KRh-Halo，分别具有线粒体、质膜和融合蛋白靶向能力，可用于活细胞中这些目标的超分辨率成像20。不同结构修饰的噁嗪衍生物荧光染料的发色强度和荧光强度也有所不同。
荧光染料的稳定性在动物成像中起着至关重要的作用，不同类型的荧光染料稳定性差异会对动物成像结果产生多方面的影响。一、对成像信号强度的影响分散荧光染料：以苯并吡喃类分散荧光染料为例，随研磨时间延长，其色浆的粒径和荧光强度均有所降低。这表明分散荧光染料的稳定性会随着时间和处理方式的变化而改变，进而影响成像信号强度。在动物成像中，如果使用这类染料，可能会因为其稳定性不足而导致成像信号逐渐减弱，影响对动物体内特定部位的清晰显示。近红外荧光染料：近红外荧光染料具有独特的优势，如对生物组织样品的穿透性较强、受背景荧光干扰小等。然而，开发高光稳定性、高荧光量子产率、低毒性的近红外荧光材料仍是难点和热点问题。例如，苯并噻唑半花菁染料（Hc-BTZ）和苯并咪唑半花菁染料（Hc-BIZ）对环境的pH值有不同程度的响应，且光稳定性有较大差异。Hc-BIZ的光稳定性远高于Hc-BTZ，但经过硼配位后，两种染料的荧光量子产率有所降低，不过仍然高于商业化的靛菁绿ICG染料IR-125。在动物成像中，光稳定性的差异会直接影响成像信号的强度和持久性。光稳定性高的染料能够在较长时间内保持较强的荧光信号，从而更有利于对动物体内进行持续观察和成像。粒子介导的荧光染料的弹道递送标记机制。广东大连荧光染料
荧光染料在细胞内离子浓度测量中起着重要的作用，不同种类的荧光染料在测量细胞内离子浓度时存在具体差异。广东流式细胞荧光染料
D-荧光素钾盐在生物发光中起着重要作用，其原理主要涉及以下几个方面。一、作为萤火虫荧光素酶底物化学反应过程：D-荧光素钾盐被萤火虫荧光素酶催化，发生氧化反应从而产生生物发光。在这个过程中，D-荧光素钾盐在酶的作用下被氧化，形成激发态的氧化荧光素，当激发态的氧化荧光素回到基态时，就会释放出光子，产生可见光29。影响发光的因素：生物发光的强度受到多种因素的影响。一方面，底物的浓度会影响发光强度，一般来说，在一定范围内增加底物浓度可以提高发光强度，但过高的浓度可能会产生抑制作用2。另一方面，环境因素如温度、pH值等也会对发光产生影响。例如，适宜的温度和pH值可以保证荧光素酶的活性，从而提高生物发光的效率。广东流式细胞荧光染料
