果蝇胚胎运动神经元的脂溶性荧光染料标记机制在果蝇中，使用油溶解的脂溶性染料对胚胎运动神经元进行逆行标记。通过微注射器将一小滴染料递送到胚胎切片制备物中，与细胞膜接触的每个运动神经元都可以被快速标记。这种标记技术可以使单个运动神经元连续标记，从而清晰地显示其精细结构细节。由于脂溶性染料有各种颜色，该技术还可以实现多色标记相邻神经元。其机制主要是利用脂溶性染料能够快速扩散进入神经元细胞膜，从而实现对神经元的标记14。通过神经鞘的电泳标记神经元群体机制在昆虫中，描述了一种通过直接从昆虫的神经和神经节的神经元鞘直接从抽吸电极传递电泳染料进行神经元标记的新方法。极示踪剂分子被传递到蝗虫的听觉神经中，而不会破坏其功能，同时染色外周感觉结构和**轴突。可以直接通过大脑表面标记局部神经元种群，并通过电泳输送钙指示剂实现体内声音诱发活动的光学成像。其机制是利用电泳的原理，将荧光染料分子在电场的作用下通过神经元鞘传递到神经元中，实现标记。噁嗪衍生物荧光染料由于其在动物神经成像方面的潜在应用价值，近年来受到了关注。青岛荧光染料ICG
温度高温可能会导致荧光染料的稳定性下降。例如，在55℃条件下放置5d后，分散荧光染料色浆的粒径有所增加1。对于壳聚糖衍生物，虽然染料的取代对其热稳定性影响较小，但特征分解温度仍会因染料的不同而有几度的变化（小于10°C）2。光照紫外光对荧光染料的破坏较大。半花菁荧光染料反式-4-[对-(N,N-二乙醇胺)苯乙烯基]-N-乙基吡啶溴化盐（DHEASPBr-C2）在紫外光下更容易受到破坏，两种染料均不同程度地产生一些光降解产物35。量子点作为稳定的荧光标记，与其他有机染料（尼罗红和DiI）相比，在连续激光照射下具有更高的稳定性10。四、纳米材料封装纳米材料封装在荧光染料周围可以提供保护层，从而提高荧光染料的稳定性。例如，用二氧化硅纳米粒子封装1,1'-diOctadeCyl-3,3,3',3'-tetramethylindocarbocyanine（DIL）合成的纳米颗粒（SIDIL），在200W的卤素灯下辐射60分钟后，与裸稀染料相比，吸光度强度更稳定，表明Si纳米颗粒包封改善了光稳定性性能7。纳米荧光染料Cy7.5将近红外荧光染料用于细胞成像，观察其在细胞内的稳定性。
分散荧光染料：分散荧光桃红BG染料色浆离心50min后的比吸光度仍达到78.1％，离心稳定性较好。在55℃条件下放置5d后分散荧光染料色浆的粒径有所增加，其中分散荧光桃红BG染料色浆粒径的增加率*为7.5％，染料色浆热稳定性能较好；加热处理过后分散荧光染料色浆的荧光强度有所降低11。这表明分散荧光染料的稳定性在一定时间和温度范围内能够保持较好，但随着时间的延长和条件的变化，其稳定性会逐渐下降。在动物成像中，这可能会限制成像的时间窗口，影响对动物体内动态过程的长期观察。近红外荧光染料：近红外荧光染料的稳定性差异会直接影响成像的持久性。光稳定性高的近红外荧光染料能够在较长时间内保持较强的荧光信号，为动物成像提供更持久的观察窗口。例如，Hc-BIZ的光稳定性远高于Hc-BTZ，这意味着在动物成像中，使用Hc-BIZ可能会获得更持久的成像效果，有利于对动物体内的长期监测和研究12。
不同类型荧光染料的稳定性直接关系到成像质量：稳定性好的荧光染料能够在动物成像过程中保持较强的荧光信号，减少信号的波动和衰减，从而提高成像的质量和清晰度。例如，神经特异性荧光染料YQN-3在特定时间内能够对动物的神经组织进行高特异性成像，其良好的稳定性有助于获得准确的神经结构图像，为手术操作提供可靠的依据8。而稳定性差的荧光染料可能会导致成像模糊、信号不稳定，影响对动物体内结构和功能的准确判断。对成像准确性的影响：荧光染料的稳定性差异还会影响成像的准确性。稳定性好的染料能够在不同的实验条件下保持相对稳定的性能，减少因染料自身变化而带来的误差。例如，在对动物特定***或组织进行成像时，稳定性高的荧光染料能够更准确地反映目标部位的真实情况，避免因染料的不稳定而导致错误的成像结果。相反，稳定性差的染料可能会使成像结果出现偏差，影响对动物体内生理和病理过程的准确理解。不同结构修饰的噁嗪衍生物荧光染料在对动物神经成像的效果上存在着一定的差异。
控制pH值荧光染料的荧光强度通常会随pH值的变化而变化。WangChao-xia在2010年的研究中指出，对于荧光黄染料，荧光强度随着pH值的增加而降低，当pH值在7～9时，荧光强度基本保持不变34。这表明在实际应用中，可以通过调节溶液的pH值来优化荧光染料的性能。不同的荧光染料对pH值的敏感性可能不同，因此在使用荧光染料时，需要了解其在不同pH值下的性能变化规律，并根据实际需求进行pH值的调整。例如，在生物医学领域，细胞内的pH值环境可能会影响荧光染料的性能，因此需要选择对pH值变化不敏感或在特定pH值范围内具有良好性能的荧光染料。控制溶剂溶剂的性质也会对荧光染料的性能产生影响。例如，在某些情况下，加入适量的酒精溶剂可能会降低荧光染料的荧光强度。WangChao-xia的研究表明，当向荧光黄染料中加入3%的酒精溶剂时，荧光强度降低约10%34。此外，溶剂的极性、粘度等性质也可能会影响荧光染料的荧光性能。在实际应用中，需要根据荧光染料的特性选择合适的溶剂，并控制溶剂的性质以提高荧光染料的性能。将近红外荧光染料置于不同温度下，观察其荧光强度的变化。天津抗体荧光染料
近红外荧光染料在实际应用中可能会受到氧气等氧化剂的影响。青岛荧光染料ICG
DiI染料标记机制DiI（1,1'-dioctadecyl-3,3,3',3'-tetramethylindocarbocyanineperchlorate）是一种亲脂性的荧光染料，常用于神经元标记。在大鼠中，通过结晶状的荧光DiI可以对牙初级传入神经元（DPANs）进行逆行荧光标记。在小鼠中，虽然也可以使用DiI进行标记，但之前*能使用Fluoro-Gold这种具有神经毒性的荧光染料，且其膜穿透特性优于碳菁染料。后来研究人员对DiI在大鼠中的标记技术进行了重新评估，旨在将其应用于小鼠。新型的DiI配方具有改进的穿透性能和染色效率，可以评估轴突染料从应用部位到三叉神经节的运输速度、染色的DPANs数量以及荧光强度。其标记机制主要是利用DiI的亲脂性，能够与神经元细胞膜结合，随着轴突的运输而扩散到神经元的各个部位，从而实现对神经元的标记。青岛荧光染料ICG
