ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验方法概述:
1. 交联:将细胞与交联剂(如1%甲醛)孵育,通常在室温下进行10-15分钟。
2. 终止交联:添加甘氨酸以终止交联反应,孵育5分钟。
3. 收集细胞:通过离心收集细胞,并用PBS洗涤以去除交联剂。
4. 细胞裂解:使用裂解缓冲液裂解细胞,释放染色质。
5. 染色质剪切:使用超声波或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段。
6. 免疫沉淀:将剪切后的染色质与特异性抗体孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗涤:用低盐、高盐和LiCl洗涤液洗涤磁珠,去除非特异性结合物。
8. 洗脱:用洗脱缓冲液洗脱DNA。
9. 逆转交联:用蛋白酶K处理,然后在65°C下加热过夜以逆转交联。
10. DNA纯化:使用商业试剂盒或标准酚/氯仿方法纯化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或进行测序以确定蛋白质结合位点。
免疫沉淀Co-IP技术选琼脂糖珠还是磁珠?南京Co IP免疫沉淀选磁珠还是琼脂糖珠
免疫沉淀Co-IP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
南京Co IP免疫沉淀选磁珠还是琼脂糖珠免疫沉淀技术Co-IP的实验设计。
免疫沉淀实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验设计概述:
1. 目标蛋白的选择:确定您想要研究的目标蛋白,例如特定的转录因子或组蛋白修饰。
2. 样本的准备:根据研究的需要选择合适的细胞或组织样本。
3. 抗体的选择:选择具有高特异性和亲和力的抗体,这对于实验的成功至关重要。
4. 交联:使用甲醛等交联剂将蛋白质与DNA在体内共价结合,形成稳定的蛋白质-DNA复合物。
5. 细胞裂解:裂解细胞以释放染色质,同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。
6. 染色质的剪切:通过超声或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段,通常在200-1000 bp之间。
7. 免疫沉淀:使用特定抗体与目标蛋白结合,然后利用蛋白A/G磁珠沉淀复合物。
8. 洗涤和洗脱:洗涤沉淀物以去除未特异性结合的蛋白质和DNA,然后洗脱目标蛋白-DNA复合物。
9. 逆转交联:使用蛋白酶K处理样品以逆转交联,释放DNA。
10. DNA的纯化和分析:纯化DNA并使用qPCR、芯片或测序技术(如ChIP-seq)进行分析。
免疫沉淀抗体的选择?
Co-IP(免疫共沉淀)技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用,其应用场景如下:
1. 蛋白质相互作用网络的鉴定:Co-IP可用于构建蛋白质相互作用网络,发现目标蛋白的结合伙伴。
2. 信号传导途径的研究:通过Co-IP技术,科学家们发现了许多关键的细胞信号通路,如MAPK和PI3K/Akt通路等,为深入理解这些通路的功能和调控机制提供了重要线索。
3. 药物靶点筛选:利用Co-IP技术,研究人员可以筛选潜在的药物靶点。
疾病机制研究:通过分析疾病相关蛋白质的相互作用,Co-IP有助于揭示疾病的分子机制。
4. 抗体药物开发:Co-IP可用于研究抗体药物与其靶标蛋白的结合特性,评估抗体药物的亲和力和特异性。
5. 转录因子研究:Co-IP技术可以用于研究转录因子与蛋白质的相互作用,进而揭示基因调控网络。
免疫沉淀ChIP技术选琼脂糖珠还是磁珠?苏州anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠的选择
免疫沉淀纯化所得抗原量低是什么原因?南京Co IP免疫沉淀选磁珠还是琼脂糖珠
Co-IP(免疫共沉淀)技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用,其实验设计如下:
1. 样品准备:Co-IP实验通常有两种,一种是内源性蛋白相互作用验证,一种是非内源性蛋白相互作用验证。内源性相互作用通过质粒共转染的方式将两种蛋白转染至同一细胞内表达;非内源性相互作用则是将含有靶蛋白的组织进行预处理及细胞裂解获得细胞裂解液。
2. 沉淀诱饵蛋白:利用磁珠偶联抗体沉淀诱饵蛋白。在样品中加入磁珠偶联抗体,抗体会与诱饵蛋白结合,利用磁铁将磁珠拉下,同时诱饵蛋白会一起被沉淀出来。
3. SDS-PAGE及WB检测:得到沉淀后,需要验证沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE将蛋白复合物分离,随后利用WB检测是否存在靶蛋白。
4. 实验对照设置:为了避免“假阳性”,需要设置正确的对照,包括阴性对照和阳性对照(Input组)。Input组为直接利用抗体对细胞裂解液进行WB检测,验证细胞裂解液中存在蛋白。
5. 结果真实性:确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的,而并非外源非特异蛋白。使用单克隆抗体有助于避免污染的发生。
南京Co IP免疫沉淀选磁珠还是琼脂糖珠
世途科生物简介:
上海世途科生物科技有限公司是一家集研发、生产、销售于一体的,为全球用户提供生物试剂的生命科学企业。世途科生物(CYTOCH)汇集了一支由海内外KOL组成的研发团队,他们在生物和化学领域拥有相当丰富的研发经验,通过将化学与生物技术相结合,致力于现有技术难点突破、新技术研究,为相关科学研究者提供思路和解决办法。
凭借着强大的研发实力和严谨的质量管理,通过产学研合作,加快客户科研成果的转化,不断推动行业的发展。