蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下冻干消化1 小时。北京FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
与IdeS不同,度拉糖肽由两个胰高xue糖素样肽-1 (GLP-1) 分子组成,它们通过柔性 GS 接头连接到人 IgG4 的 Fc 区域。为了分别研究肽和 Fc 区域,从而鉴定结构域特异性 PTM,用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下冻干消化度拉糖肽 1 小时。为了降低样品复杂性,使用内切糖苷酶GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖,并用DTT还原链间二硫键。反相LC-MS对样品的分析表明,使用GlySERIAS进行连接子消化后,肽从Fc区域完全去除。连接子中的大量甘氨酸残基为GlySERIAS提供了许多不同的潜在消化位点,这就是为什么Fc/2和GLP-1肽都被检测为几种变体,其中不同数量的甘氨酸和丝氨酸残基仍然连接。此外,还鉴定了GLP-1肽的氧化。尽管GlySERIAS同时在多个位点进行消化,但一式三份的酶解在获得的不同Fc/2变体的相对量中显示出可重复的结果。北京FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶有助于监测多种CQA,例如糖基化、氧化和C端赖氨酸剪切。
Genovis提供冻干和固定化的FabRICATOR(IdeS),为客户提供了许多选择,以满足他们的需求。 冻干形式用于高度灵活的方法开发的目的,并随时准备使用,只需重组和添加到IgG样本。 冻干酶的灵活性也意味着它可以应用于更高的通量和自动化的工作流程。 Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶,在随时可用的旋转柱中,这可以极大限度地减少在样品中残留的酶,这可能是有利的。 对于更多的制备应用,我们提供FabRICATOR Fab2试剂盒,这是IgG片段生成和纯化的强大工具。 这包括FabRICATOR固定化柱和CaptureSelect Fc纯化柱,用于亚基的亲和纯化。 由于FabRICATOR在非还原条件下是活性的,F(ab’)2片段保留其链间和链内二硫键,如果片段想用于结合研究,这一点尤为重要,因为结合效率和免疫反应性将被保留。
Genovis的FabDELLO在铰链上方的单个位点消化人IgG1,并在两小时内生成均质的Fab和Fc片段(Genovis的IdeS在铰链区下方的单个位点进行消化)。生成的片段可用于结晶和高阶结构(HOS)的NMR研究、结合研究等。突变的铰链区域是zhiliao性候选抗体的常见修饰,以降低效应器功能。这些突变可能会影响具有高底物特异性的酶的抗体消化效率。例如,高度特异性的FabRICATOR(IdeS)消化效率对含有常见LALA突变的抗体产生负面影响。FabDELLO作用于人IgG1铰链上方的单个暴露赖氨酸残基,能够对具有突变铰链区域的抗体进行流行的中级LC-MS分析。例如,用FabDELLO消化市售的IgG1risankizumab,在下铰链区域具有LALA突变,并通过反相LC-MS进行分析。消化产生均匀的Fab和Fc片段。用20mMDTT还原片段,用于中级LC-MS分析,发现产生了均相的Fc/2、轻链(LC)和Fd片段。用FabDELLO消化后观察到的定义峰显示出均匀的片段生成和酶的稳健性能。含有富含甘氨酸的连接子的各种mAb片段进行详细表征的中级方法。
对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用,需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段,但非特异性酶活性需要仔细优化,以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点,可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 (HOS) 的 NMR 研究、结合研究等。在这里,我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化,用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠,因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率,在加入SDS上样缓冲液之前,停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。GingisREX与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽。甘肃GlycINATORIdeS蛋白酶蛋白组学
Genovis的IdeS蛋白酶是IgG特异性半胱氨酸蛋白酶。北京FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
Genovis的FabRICATOR(IdeS)酶 可用于 IgG 的所有人类亚类以及人源化和嵌合 IgG。该酶对其他物种的 IgG 也有活性,包括来自大鼠、猴子、兔子和绵羊的某些类别的 IgG。因此,FabRICATOR的高特异性在某些情况下会使其对铰链区域的突变敏感,并损害酶活性。来自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成,与 FabRICATOR 相比,FabRICATOR Z 在消化这些 IgG 方面具有更高的效率。然而,小鼠 IgG1 在铰链下方具有不同的序列,并且不被 FabRICATOR Z 消化。对于这种抗体种类,FabULOUS 和 FabULOUS Fab 试剂盒可用于制备 Fab 片段。北京FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
经过多年的经验积累及市场积淀,倍笃生物已组合多条不同产品线,分别满足体外诊断、organoid及干细...
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