大规模生产阶段，AAV/LV载体生产流程跟抗体、疫苗类药物的生产类似，主要包含上游培养、下游纯化及制剂部分。上游培养分为质粒开发、细胞扩增、三质粒共转染及病毒载体生产等步骤。下游纯化分为细胞裂解释放AAV病毒颗粒（可以通过去污剂、机械作用、高渗或冻融操作等）or收获细胞上清液得到含LV病毒原液、加入核酸酶以减少宿主细胞核酸污染、澄清是通过离心或过滤等方法去除细胞碎片和杂质等、超滤浓缩以减少后续色谱纯化体系、亲合及离子交换等纯化得到高纯度病毒载体。制剂部分主要是超滤更换缓冲液、过滤除菌及制剂灌装等。SAN HQ GMP是全球shou款市售GMP级别高盐核酸酶，于2023年Q4上市。黑龙江500mM盐浓度条件高盐核酸酶70921-160
染色质由组蛋白和DNA组成，——147个碱基对的DNA缠绕在8个组蛋白（由H2A、H2B、H3和H4形成的八聚体）周围，形成基本的染色质单位，即核小体。核小体像珠串一样串连在一起，并被包装成更高阶的染色质结构。DNA带负电荷，富含碱性氨基酸的组蛋白带正电荷，且组蛋白多聚物有很多疏水区段。所有这些特点导致宿主DNA残留（HCD）能吸附很多物质，包括宿主蛋白残留（HCD）、色谱填料、目的病毒颗粒等，因此，HCD的存在增加了工艺流程的复杂度，同时也降低了病毒颗粒的稳定性。江苏高盐条件高盐核酸酶70921-150高盐能够抑制AAV病毒载体聚集，提高AAV病毒载体产量。
在不同的盐浓度条件下，AAV病毒载体的存在形式不同。低盐浓度条件下，AAV病毒颗粒表面会通过电荷作用等非特异结合到HCD上，从而产生病毒颗粒团聚现象。随着溶液盐浓度上升，AAV病毒颗粒与HCD的离子相互作用会被破坏，AAV病毒颗粒会逐渐解离。当盐浓度升到更高范围（>400mM左右），AAV病毒颗粒与HCD的结合更弱，AAV颗粒更稳定。因此，在高盐浓度溶液中，AAV颗粒更加稳定，且有数据表明高盐浓度不会削弱AAV的侵染能力。所以，我们推荐提高AAV病毒生产中的盐浓度。
从国内来看，由于 AAV 基因药物研发管线绝大部分集中在眼科遗传病上，载体用量较小，三质粒共转染 AAV 系统足以满足未来的临床及商业需求，因此，国内的 AAV 生产系统主要以三质粒为主。然而，考虑到未来 AAV 基因药物在血液、神经系统、肌肉系统等领域的临床应用，三质粒系统显然难以胜任。如药明生基从国外收购了 OXGENE 的辅助腺病毒 AAV 生产系统 TESSA，据报道较三质粒系统有10倍的提升；而基因药物 CDMO 企业北京五加和基因则在国内率先采用了陈海峰博士的威洛克公司授权的Bac-to-AAV 系统，凭借公司在病毒载体领域持续30年的研发经验，不断摸索、试验，终于在临床级生产方面获得了巨大的成功，为 AAV 基因药物管线研发公司锦篮基因进行多批次临床 CDMO 代工生产。ArcticZymes厂家管控整个供应链及生产流程，协助客户进行文件审计及现场审计。
综合腺相关病毒AAV制备的三个工艺阶段介绍，可以看出下游处理可以占病毒生产总成本的很大一部分，而且难度也是非常大，尤其是纯化过程。原因之一是由于有超过100种不同血清型的变体AAV衣壳，不同血清型的AAV蛋白存在差异。因此，各种血清型的表面特性增加AAV纯化难度。原因之二是：针对工艺和产品相关的杂质（包括宿主细胞物质，DNA和空衣壳），缺乏一个有效和可重复的平台方法，尤其是来从空衣壳中分离出完整的衣壳。为了解决以上问题，国内外大的药企公司都致力于纯化新产品的开发，以期达到：（1）实现病毒颗粒的分离（2）减少产品相关杂质（3）保持效力和产量的目标。SAN HQ高盐核酸酶是一种新型的、耐高盐的工程化内切酶；天津高盐条件高盐核酸酶
SAN HQ高盐核酸酶有助于减少了宿主细胞残留DNA的污染，提高了基因药物的安全性。黑龙江500mM盐浓度条件高盐核酸酶70921-160
ArcticZymes Technologies提供独特特性的盐活性核酸酶（Salt Active Nucleases，SANs）系列产品，主要包含SAN HQ高盐核酸酶和M-SAN HQ中盐核酸酶。这两款酶都是非特异核酸内切酶，跟Benzonase一样能高效降解任何形式（双链、单链、线状、环状）的DNA和RNA；都来自于深海microbes，通过Pichia pastoris发酵生产得到。这两款酶的区别在于发挥酶活的适宜盐浓度不同，——M-SAN HQ中盐核酸酶的适宜盐浓度在175mM-250mM，而SAN HQ高盐核酸酶的适宜盐浓度在400mM-600mM。黑龙江500mM盐浓度条件高盐核酸酶70921-160
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