离子交换层析 (IEC) 是一种简单、通用且经济高效的技术，已成为许多载体纯化的关键步骤。IEC分为阴离子/阳离子交换柱，其中AEC（Anion-exchange chromatography）适用于AAV纯化，是大规模AAV生产中去除空衣壳的主要手段。AAV衣壳亚种之间因表面电荷的差异导致不同的的等电点。空衣壳PI在6.3左右，包装了完整基因组DNA后的病毒颗粒PI大致为5.9。AAV与基质之间的静电相互作用正是取决于衣壳的等电点(pI)和缓冲液的pH值。基于这一原理在正电荷固定相上进行样品的分离纯化，去除杂质（如空衣壳和部分衣壳），并有效地回收目的载体。ArcticZymes致力于提供高质量产品，具有好的批间一致性、稳定可靠的质量。甘肃高盐核酸酶70921
市售的SAN HQ高盐核酸酶有三个规格，分别是25kU、500kU及5MU，分别满足研发初期及大规模生产各阶段的要求。通过SDS-PAGE检测蛋白纯度在98%以上。基于ArcticZymes Technologies的30年的酶学开发及大规模生产经验，SAN HQ的生产体系稳定，产品纯度高，批次一致性好，无蛋白酶活性。厂家开发出特异的缓冲液体系，使SAN HQ保存起来更加稳定，-15℃ - -30℃条件下有效期3年左右。研究数据表明，经过5-6次的反复冻融，SAN HQ高盐核酸酶活性没有明显变化。湖北高盐核酸酶70921使用SAN HQ高盐核酸酶可以更少的酶量获得更高的去除率，对载体的产量和活性没有任何负面影响；
在生物工艺中，核酸酶的主要作用是高效消化宿主细胞DNA（HCD），并将其分解成足够小的片段，以便在下游纯化过程中去除。虽然大多数核酸酶可以在生理盐条件下高效地将裸DNA降解成微小片段，比如Benzonase和SANs都可以把dsDNA分解成小于8nt的寡核苷酸链，但实际生产中的核酸污染情况更加复杂。HCD通常以染色质形式存在，与细胞裂解碎片、病毒颗粒等结合在一起，影响核酸酶的识别及剪切。因此，HCD去除的关键在于——核酸酶如何在复杂的生产体系中识别并剪切HCD。
AAV病毒滴度通常分为物理滴度和infection滴度。物理滴度一般是指基因组滴度或者衣壳滴度。在测定AAV的含量时，通常采用基因组滴度或者衣壳滴度作为单位，其中基因组滴度为携带基因组的AAV的浓度，衣壳滴度为AAV物理颗粒的浓度。基因组滴度一般采用qPCR、ddPCR、染料法、UV/Vis等方法来测定；衣壳滴度主要是通过ELISA、HPLC等方法来测定。AAV基因组滴度检测的关键在于尽可能彻底去除AAV衣壳外的HCD残留，减少污染核酸对qPCR或ddPCR的影响。经典方法是加入常规核酸酶（如Dnase I、Benzonase等）消化AAV衣壳外的HCD残留，然后加入Proteinase K破碎病毒衣壳，进行后续检测。经过对比发现，用SAN HQ高盐核酸酶替代常规核酸酶处理AAV病毒，能够更高效去除衣壳外的核酸残留，qPCR或ddPCR结果重复性更高、更稳定。SAN HQ GMP是全球shou款市售GMP级别高盐核酸酶，于2023年Q4上市。
三种AAV载体的生产体系（三质粒瞬转体系、杆状病毒表达载体体系以及包装细胞体系） 中都会出现三种衣壳：完整衣壳（full capsid）、部分衣壳（partial capsid），和空衣壳（empty capsid）。其中完整衣壳包含正确的DNA序列，是人们所期待的产品；部分衣壳和空衣壳包含部分不包含目的基因，属于生产中的杂质，约占细胞生产的总AAV颗粒的50%-90%。空衣壳/部分衣壳有如下几种危害：1), 影响产品的纯度，2), 增加终产品的免疫原性，3), 与完整衣壳竞争infection细胞上的载体结合受体，抑制完整衣壳的转导，4),增加总体病毒载量。部分衣壳与空衣壳地存在严重地影响了AAV产品的安全性和有效性，因此监管机构强烈建议在整个生产过程中监控空/完整衣壳比（空壳率）。SAN HQ高盐核酸酶的生产用原辅料是Non-animal和Non-plant来源的。云南SAN HQ高盐核酸酶70921-160
使用Benzonase时，不能把载体表面的DNA去除彻底，因而不能阻止纯化的病毒载体聚集。甘肃高盐核酸酶70921
氯化铯(CsCl)/碘克沙醇密度梯度离心大概是经典的AAV纯化技术了。这种技术适用于所有血清型且分辨率高，但是因生产工艺很难放大，低通量等缺点阻碍了其在工业中的应用。继密度梯度离心之后，色谱法不断发展，并逐渐成为一种成熟的、主流的方法。色谱法通过载体的净电荷、疏水性、对配体的亲和性、大小以及其他性质来分离并纯化载体。这类技术有诸多的优点：更具可扩展性和成本效益，可多次重复使用，可并行运行或串联运行，还可有效去除非定植剂，这是开发后期的一个关键方面。甘肃高盐核酸酶70921
残留的宿主DNA是生产中产生的杂质，其存在潜在的致瘤性、传染性和免疫原性等风险。相关研究表明，基因的...
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