使用生物菌肥的注意事项：一、避免光照直射。光照直射的情况下，一些菌都会杀死。二、蘸根的时候要有一定的量。蘸根时候有一定的浓度，如果稀释的很稀了，蘸上效果也不好。三、不能与农药混用。化肥农药大面积混在一起的时候很可能会把菌杀死，施了生物菌肥以后，接着倒上杀菌药，也会把它杀死，效果不好了，施了生物菌肥，熏地熏蒸或者高温消毒，都会对菌有危害，使用不当也会造成，生物菌肥的效果不好，施到地里以后，PH值也是有关系的，土壤中PH值，如果酸性土壤施上效果不好，大部分菌施上都不好，如果是稍碱性的土壤施比较好，所以比较好调节一下，土壤中的PH值，多使用点石灰草木灰四、使用生物菌肥一定要投入有机肥。如果没有有机肥纯使用生物菌效果也不好，生物菌需要一定的，有机质进行分解，进行繁殖，生物菌有粮食，它吃饭才进行繁殖，多施点有机肥才能繁殖，长得比较好。同时，这些菌种还能分解土壤中的有机物质，释放出更多的养分供作物吸收利用，提高土壤肥力和作物产量。海南本地生物菌肥技术指导
注意棚温、地温和水温。施用菌肥的比较好温度是25～37℃，低于5℃，高于45℃，施用效果较差。对高温、低温、干旱条件下的农作物田块不宜施用。同时还应掌握固氮菌**适温度，土壤含水量是60～70%左右。因量制宜。对于多年来用化肥的田块施用了生物菌肥不能大量减施化肥和有机肥，因农作物对化肥产生了依赖性，用生物菌肥取代氮肥不能一下子适应，因此，其取代量应做到、二、三年分别取代30%、40%和60%。磷、钾肥只能补足，不能减少。因时制宜。生物菌肥不是***肥，所以，要在作物的营养临界期和大量吸收期前7～10天施用效果比较好。同时对不同作物或同一作物的不同时期，要选用不同的施用方法，作物叶背茸毛的多少、叶片蜡质的厚薄都会影响其使用效果。辽宁功能性生物菌肥品质保障含固氮菌的菌肥还可以固定空气中的氮素，直接提供植物养分，各种菌肥能固定的氮素数量十分有限。
有机肥与生物菌肥的区别①侧重点不同：有机肥是一种肥料，但生物菌肥的落脚点在菌上，更偏向其功能性，如提高肥力、促进土壤中难溶的矿质营养释放、增强植物抗病抗逆能力等。②使用方式不同：有机肥一般是作底肥、或生长期追肥；菌肥可用于拌种、基肥、追肥、蘸根等。③使用条件不同：有机肥一般无特殊的限制条件，但菌肥是“活”的，所以不可与杀虫剂、杀菌剂混用，也不能长期暴露于阳光照射下。此外，土壤的含水量、温度、pH条件等也会影响菌肥的效果。
生物菌肥具有以下特点：有机性：生物菌肥主要由有机物质组成，不含化学合成的化肥成分，对土壤和环境无污染。菌种丰富：生物菌肥中含有多种有益微生物菌种，能够促进土壤中的生物活性，改善土壤结构。营养：生物菌肥中的微生物菌种能够分解有机物质，释放出植物所需的养分，提供多方面的营养供给。促进植物生长：生物菌肥中的微生物菌种能够与植物根系形成共生关系，促进植物的生长和发育。提高作物抗病能力：生物菌肥中的微生物菌种提高作物的抗病能力。增加土壤肥力：生物菌肥中的微生物菌种能够分解有机物质，增加土壤的有机质含量，提高土壤肥力。可以改善土壤团粒结构，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，并能改善土壤的通气状况。
果树用完生物肥的实际验证结果：对果品品质的影响。在苹果、葡萄、梨、草莓和猕猴桃等多个树种上的研究结果表明，微生物肥料明显提高了果品品质。内在品质上主要提高了果实的可溶性固形物和含糖量、糖酸比和香气品质；从外在品质看，提高了果实着色度和硬度，果形大小较匀称。施用微生物肥料有效增加了果实单果重并显着提高了单位面积产量，果园施用微生物肥料后，苹果、桃、葡萄、李子的产量，分别增产29.8%、27.7%、12.6%、21.1%设施桃树上施用微生物肥料后，显着提高了土壤温度，10厘米根际土壤温度平均升高2.2℃；促进了土壤表层根系的发生与生长，细根数量比对照增加1.5倍；明显提高了桃的坐果率：生物菌肥采用天然的微生物技术，不含有害物质，对环境友好，符合可持续农业发展的要求。辽宁功能性生物菌肥品质保障
微生物肥料是以微生物的生命活动导致农作物得到特定的肥料效应而使作物生长茁壮或产量增加的一类制品。海南本地生物菌肥技术指导
地温会在一天当中随着气温变化而变化。但是对于覆膜或是大棚种植来说，温室中随着土壤深度的增加，地温的变化幅度会逐渐减小。比如20cm以上的土层地温会受气温较大的影响，但是对20cm以下就不明显了，甚至会出现一定推迟，比如在太阳落山气温降低后，土层20cm以下的地温仍然保持较高的温度。天气虽然影响气温的变化，但是对地温来说，尤其是温室，地面深度越深，受气温影响也就越小。也就是说，即使气温是几度、十几度，但是地温可能保持在十几度、二十度，仍然在生物菌的活性范围内。海南本地生物菌肥技术指导
