自从引入了细菌的基因组学分析以来,针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法,常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异,因为这种差异通常很小。相反地,宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组,这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。肠道菌群检测有重大意义;上海腹泻菌群检测报告内容
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肠道菌群失调与自身免疫疾病的发展相关。Nature Communications上发表的一项新研究,发现类风湿关节炎(RA)的发生与肠道屏障功能的受损密切相关,新发病RA患者的血清连蛋白表达增加,而肠道紧密连接蛋白表达降低。在关节炎小鼠模型中,肠道炎症发生早于关节炎的发病,而靶向肠道屏障或连蛋白可起到缓解关节炎的作用。该研究提示,靶向肠道屏障或是改善类风湿关节炎等自身免疫疾病的潜在策略。①对比40名RA患者、41名健康对照、19名cancer患者及21名丙肝患者,发现RA患者的血清连蛋白水平明显升高;②纵向研究结果显示,血清连蛋白水平较高者在1年内发生RA的风险更高;③RA患者(包括新发病患者)肠道上皮细胞中的紧密连接蛋白(包括occludin与claudin-1)表达明显降低;④在胶原诱导的关节炎(CIA)小鼠模型中,肠道炎症及T细胞在肠道中的累积发生于关节炎发病之前;⑤丁酸盐处理降低肠道通透性,或使用药物靶向抑制连蛋白可缓解CIA。
从功能上讲,痛风患者的果糖、甘露糖代谢和脂质A生物合成基因丰度较高,尿酸降解和短链脂肪酸生成基因丰度较低。结合临床数据分析得到肠杆菌科物种丰度的降低与氨基酸代谢和环境感知的降低有关,这两者共同导致痛风患者血清尿酸和C反应蛋白水平升高。基于三个肠道微生物基因的随机森林分类器在发现和验证队列中对痛风病症具有较高的预测性(准确度为0.91和0.80)。纵向分析表明,24周后,降尿酸恢复了部分肠道微生物群。与肥胖、2型糖尿病(T2D)、强直性脊柱炎(AS)和类风湿性关节炎(RA)的对比分析表明,与代谢性疾病相比,痛风的宏基因组跟自身免疫性疾病的相似度更高。该研究揭示了肠道生态失调与宿主尿酸盐降解和全身炎症的失调有关,可作为痛风的非侵入性诊断标志物。肠道菌群--守护您的健康。
来自北京协和医院的张烜团队与华大基因的揭著业团队在JournalofAutoimmunity上发表的一项研究,对比分析了强直性脊柱炎患者与健康人的肠道菌群后发现,患者的菌群组成及功能发生变化,且患者的菌群可能通过分子模拟触发自身免疫反应。对比分析85名强直性脊柱炎(AS)患者及62名健康人的肠道菌群,发现惰性真杆菌等5种菌种在AS患者中富集;② 在AS患者的肠道菌群中,氧化磷酸化、脂多糖生物合成和粘多糖降解作用增强;③ AS患者中存在脆弱拟杆菌和III型分泌系统等与自身免疫相关的特征;④ AS患者肠道菌群中部分富集的细菌多肽可模拟II型胶原,并促进特定HLA分类(HLA-B27)AS患者的PBMC产生IFN-γ。上海沃本——您身边的肠道菌群检测选择;上海自闭症患者菌群检测临床应用
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中山大学附属第三医院的古洁若团队与金瓯团队在Frontiers in Immunology上发表的一项新研究结果,在30名强直性脊柱炎(AS)患者及24名健康对照中发现,接受6个月的阿达木单抗改善后,患者的肠道菌群α-多样性及组成均趋近于健康对照。该研究结果提示,肠道菌群或可作为阿达木单抗改善AS患者的疗效评估标志物。①纳入30名AS患者及24名健康对照,患者的肠道菌群α-多样性明显低于对照,且肠道菌群组成明显不同;②接受6个月的阿达木单抗改善后,患者的肠道菌群α-多样性增加,且与对照无明显差异,肠道菌群组成也更趋近于对照;③对比22名对阿达木单抗改善应答者及8名不应答者,在改善前,2组患者的肠道菌群α-多样性及组成无明显差异,但不应答者的丛毛单胞菌属丰度更高。上海腹泻菌群检测报告内容