RNA提取试剂的选择:选择合适的提取试剂是较重要的一步。好的提取试剂在确保成功的同时,操作方便且经济实用。对于动物组织、简单的植物材料、各种微生物、培养细胞的totalRNA提取,Takara公司的RNAisoPlus具有诸多的成功案例。随着2013年7月柱型提取试剂TaKaRaMiniBESTUniversalTotalRNAExtractionKit的成功上市,进一步丰富了TakaraRNA提取的产品线。该产品采用了独特的细胞裂解系统,无需苯酚氯仿抽提等步骤,简单快捷。组织或细胞裂解后,提取操作光需20分钟便可完成。细胞质和细胞核RNA提取试剂盒特点:试剂盒可用于哺乳动物细胞或者组织样品的提取。上海郑州RNA提取试剂
RNA提取浓度不高或质量不佳原因及解决办法:1、得率过低:提取样本过低总量不足或者提取样本过多裂解不彻底;应当使用适当质量的组织或细胞进行提取,样本前处理一定要做好,裂解应充分。2、基因组残留:Trizol法提取时,分层后吸取上清时吸到中间层会带来严重的基因组污染;分层吸取时应当格外小心,不要吸取到中间层。如果是采用柱式法提取,可选择含有DNaseI的试剂盒进行提取,吸附在膜上的核酸直接用DNaseI进行消化,可极大限度的降低DNA残留。上海郑州RNA提取试剂RNA提取试剂TRIpure是基于世界上使用较普遍的异硫氰酸胍/酚法研制而成的总RNA抽提试剂。
植物RNA提取:植物组织中,富含酚类化合物,或富含多糖,或含有某些尚无法确定的次级代谢产物,或RNase的活性较高。这些物质在细胞裂解后与RNA紧密结合形成难溶复合物或者胶状沉淀,很难将其去除。所以我们在提取植物组织时,要选取针对植物的试剂盒,试剂盒里的裂解液能有效解决多酚易氧化、多糖化合物与核酸分离等难题。1、植物的果皮、果肉、种子、叶片等要在研钵中充分研磨,研磨过程中液氮要及时补充,避免样品融化,研磨后的样品应迅速加入裂解液中震荡混匀,避免RNA降解。2、像水稻及小麦叶片等富含纤维的样本,则应适当减少提取用量,否则组织研磨及裂解不彻底,会使提取的RNA产量较低。3、含水分较多的植物组织例如石榴果实、西瓜果实、桃子果实等则应当适当提高样本量(可选100~200mg)。4、植物组织,如植物叶片、根茎、坚硬的果实等材料一般建议使用液氮在研钵中彻底研钵成份,再继续进行提取步骤。常规的组织匀浆机对植物组织的匀浆效果可能不佳,一般不建议使用。
动物细胞RNA提取:1、悬浮细胞:可直接离心后弃掉培养基,用无菌PBS清洗1~2遍后,再用适量PBS悬浮起来,然后再加入裂解液进行裂解。千万不要完全弃掉液体后,往沉淀细胞里直接加入裂解液,这样会使外表层的细胞裂解后释放的组蛋白包裹粘附在沉淀细胞外侧,从而限制沉淀内部的细胞与裂解液的接触,从而导致细胞裂解不彻底,降低RNA得率。2、半贴壁或贴壁不紧的细胞:弃掉培养基后,用PBS洗1~2次,然后直接吸取适量PBS用吸管或者泵吹打培养皿,把细胞吹下来,转移到无RNA酶的EP管中,加裂解液进行提取。3、贴壁细胞:需要先用胰酶消化,然后收集到无RNA酶的EP管中,离心去其上清,用PBS洗1~2次,去除多余的胰酶,以适量PBS重悬后继续进行提取步骤。细胞质和细胞核RNA提取试剂盒特点:方便快捷的离心柱操作方式。
新型土壤总RNA快速提取试剂盒:独特裂解剂/裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后RNA在高离序盐状态下选择性吸附于玻璃奶,然后将粗纯化的玻璃奶转移到离心柱,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,漂洗液将腐植酸、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,较后低盐的洗脱缓冲液将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。试剂盒特点:离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界有名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。兼容性强,适用于各种不同的土壤、粪便以及其他soil.不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。快速,简捷,单个样品操作一般可在1小时内完成。多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.9以上,可直接用于PCR,Northern-blot和各种酶切反应DNA/RNA Shield 也会保证取样时微生物基因多样性不会发生改变。上海郑州RNA提取试剂
细胞质和细胞核RNA提取试剂盒特点:有效分离和提取细胞质RNA,与细胞核RNA。上海郑州RNA提取试剂
RNA稳定方法:1.在裂解缓冲液中立即溶解,使RNase失活。然后样品可以立即处理或冷冻保存。2.浸泡在稳定试剂中(如DNA/RNAShield),使核酸酶失活,并在环境温度下长时间保护核酸。这对正在实地收集样本或处理珍贵的病人样本(例如组织活检、全血等)的研究人员特别有帮助。确保样品完全溶解:在RNA提取过程中,较大限度地提高RNA产量和质量的较佳方法是保证样品的完全裂解。然而,并不是所有的样本都对相同的裂解方案敏感。例如,血细胞(如淋巴细胞、PBMCs等)和微生物细胞往往更难以有效地溶解。光光添加基于洗涤剂的裂解缓冲液可能并不总是足够的。为了提高裂解效果,可以将裂解缓冲液与机械裂解步骤(研磨珠破碎)匹配,或者在裂解液上游加入酶裂解步骤(如蛋白酶K、溶菌酶等)。上海郑州RNA提取试剂
RNA提取关键点病菌RNA在提取后也仍然具有传染性,在提取时,实验人员需要佩戴口罩和手套等各种防护装备,以防实验室污染。而有种「自动灭活」的方法,在更加便利的同时,也能更好的保护实验人员的安全。许多样品中含有高水平的RNase,这种酶也会加速RNA的降解。为了使这种酶对降解的影响较小化,较好在采集时就稳定好样本中的RNA。这种情况下,可以在裂解缓冲液中立即进行溶解。比如可以通过TRIzol®、RNA裂解缓冲液等使RNase失活,然后再处理样本。另外,再采集样本之后马上加入DNA/RNAShield,可以快速降解掉RNase等蛋白物质。当然,DNA/RNAShield也会保证取样时微生物基因多样...